Protein–RNA interactions for Protein: O35464

Sema6a, Semaphorin-6A, mousemouse

Predictions only

Length 1,031 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6aO35464 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sema6aO35464 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sema6aO35464 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sema6aO35464 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sema6aO35464 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sema6aO35464 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sema6aO35464 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sema6aO35464 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Sema6aO35464 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sema6aO35464 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sema6aO35464 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Sema6aO35464 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sema6aO35464 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sema6aO35464 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sema6aO35464 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sema6aO35464 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sema6aO35464 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sema6aO35464 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sema6aO35464 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sema6aO35464 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sema6aO35464 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sema6aO35464 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sema6aO35464 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sema6aO35464 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sema6aO35464 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sema6aO35464 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sema6aO35464 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sema6aO35464 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sema6aO35464 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sema6aO35464 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sema6aO35464 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sema6aO35464 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sema6aO35464 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sema6aO35464 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sema6aO35464 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sema6aO35464 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Sema6aO35464 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sema6aO35464 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sema6aO35464 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sema6aO35464 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sema6aO35464 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sema6aO35464 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Sema6aO35464 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sema6aO35464 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sema6aO35464 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sema6aO35464 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sema6aO35464 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sema6aO35464 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sema6aO35464 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sema6aO35464 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Sema6aO35464 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sema6aO35464 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sema6aO35464 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sema6aO35464 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sema6aO35464 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sema6aO35464 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sema6aO35464 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sema6aO35464 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sema6aO35464 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sema6aO35464 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sema6aO35464 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sema6aO35464 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sema6aO35464 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sema6aO35464 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sema6aO35464 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sema6aO35464 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sema6aO35464 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sema6aO35464 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sema6aO35464 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sema6aO35464 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sema6aO35464 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sema6aO35464 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sema6aO35464 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sema6aO35464 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sema6aO35464 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sema6aO35464 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sema6aO35464 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sema6aO35464 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sema6aO35464 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sema6aO35464 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sema6aO35464 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sema6aO35464 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sema6aO35464 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sema6aO35464 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sema6aO35464 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sema6aO35464 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sema6aO35464 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sema6aO35464 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sema6aO35464 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sema6aO35464 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sema6aO35464 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sema6aO35464 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sema6aO35464 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sema6aO35464 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sema6aO35464 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sema6aO35464 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sema6aO35464 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sema6aO35464 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sema6aO35464 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Sema6aO35464 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.5 ms