Protein–RNA interactions for Protein: O35457

Ccrl2, C-C chemokine receptor-like 2, mousemouse

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Length 360 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccrl2O35457 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccrl2O35457 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccrl2O35457 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccrl2O35457 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccrl2O35457 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccrl2O35457 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccrl2O35457 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccrl2O35457 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccrl2O35457 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccrl2O35457 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccrl2O35457 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccrl2O35457 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccrl2O35457 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccrl2O35457 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccrl2O35457 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccrl2O35457 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccrl2O35457 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccrl2O35457 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccrl2O35457 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccrl2O35457 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccrl2O35457 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccrl2O35457 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccrl2O35457 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccrl2O35457 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccrl2O35457 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccrl2O35457 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccrl2O35457 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccrl2O35457 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccrl2O35457 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccrl2O35457 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccrl2O35457 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccrl2O35457 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccrl2O35457 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccrl2O35457 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccrl2O35457 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccrl2O35457 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccrl2O35457 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccrl2O35457 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccrl2O35457 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccrl2O35457 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccrl2O35457 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccrl2O35457 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccrl2O35457 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccrl2O35457 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccrl2O35457 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccrl2O35457 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccrl2O35457 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccrl2O35457 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccrl2O35457 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccrl2O35457 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccrl2O35457 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccrl2O35457 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccrl2O35457 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccrl2O35457 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccrl2O35457 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccrl2O35457 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccrl2O35457 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccrl2O35457 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccrl2O35457 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccrl2O35457 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccrl2O35457 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccrl2O35457 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccrl2O35457 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccrl2O35457 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccrl2O35457 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccrl2O35457 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccrl2O35457 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccrl2O35457 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccrl2O35457 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccrl2O35457 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccrl2O35457 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccrl2O35457 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccrl2O35457 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccrl2O35457 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccrl2O35457 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccrl2O35457 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccrl2O35457 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccrl2O35457 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccrl2O35457 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccrl2O35457 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccrl2O35457 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccrl2O35457 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccrl2O35457 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccrl2O35457 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccrl2O35457 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccrl2O35457 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccrl2O35457 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccrl2O35457 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccrl2O35457 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccrl2O35457 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccrl2O35457 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccrl2O35457 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccrl2O35457 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccrl2O35457 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccrl2O35457 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccrl2O35457 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccrl2O35457 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccrl2O35457 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccrl2O35457 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccrl2O35457 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
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