Protein–RNA interactions for Protein: O35452

Tnxb, Tenascin X, mousemouse

Predictions only

Length 4,006 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnxbO35452 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
TnxbO35452 Snhg8-201ENSMUST00000196466 448 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
TnxbO35452 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
TnxbO35452 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
TnxbO35452 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
TnxbO35452 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
TnxbO35452 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
TnxbO35452 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
TnxbO35452 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
TnxbO35452 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
TnxbO35452 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
TnxbO35452 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
TnxbO35452 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
TnxbO35452 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
TnxbO35452 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
TnxbO35452 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
TnxbO35452 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TnxbO35452 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TnxbO35452 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TnxbO35452 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
TnxbO35452 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
TnxbO35452 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
TnxbO35452 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
TnxbO35452 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
TnxbO35452 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TnxbO35452 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TnxbO35452 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
TnxbO35452 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
TnxbO35452 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TnxbO35452 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TnxbO35452 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TnxbO35452 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TnxbO35452 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
TnxbO35452 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TnxbO35452 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TnxbO35452 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
TnxbO35452 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TnxbO35452 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TnxbO35452 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TnxbO35452 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
TnxbO35452 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TnxbO35452 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
TnxbO35452 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
TnxbO35452 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TnxbO35452 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
TnxbO35452 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TnxbO35452 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TnxbO35452 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
TnxbO35452 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
TnxbO35452 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
TnxbO35452 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
TnxbO35452 Sst-201ENSMUST00000004480 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TnxbO35452 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
TnxbO35452 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
TnxbO35452 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TnxbO35452 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TnxbO35452 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TnxbO35452 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
TnxbO35452 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
TnxbO35452 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TnxbO35452 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
TnxbO35452 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TnxbO35452 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TnxbO35452 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TnxbO35452 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TnxbO35452 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TnxbO35452 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TnxbO35452 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
TnxbO35452 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
TnxbO35452 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TnxbO35452 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TnxbO35452 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TnxbO35452 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
TnxbO35452 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
TnxbO35452 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
TnxbO35452 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
TnxbO35452 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
TnxbO35452 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
TnxbO35452 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
TnxbO35452 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
TnxbO35452 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
TnxbO35452 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
TnxbO35452 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
TnxbO35452 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
TnxbO35452 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
TnxbO35452 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
TnxbO35452 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
TnxbO35452 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
TnxbO35452 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
TnxbO35452 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
TnxbO35452 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
TnxbO35452 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
TnxbO35452 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
TnxbO35452 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
TnxbO35452 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
TnxbO35452 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
TnxbO35452 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
TnxbO35452 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
TnxbO35452 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
TnxbO35452 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms