Protein–RNA interactions for Protein: O35426

Xbp1, X-box-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xbp1O35426 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Xbp1O35426 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Xbp1O35426 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Xbp1O35426 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Xbp1O35426 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Xbp1O35426 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Xbp1O35426 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Xbp1O35426 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Xbp1O35426 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Xbp1O35426 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Xbp1O35426 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Xbp1O35426 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Xbp1O35426 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Xbp1O35426 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Xbp1O35426 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Xbp1O35426 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Xbp1O35426 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Xbp1O35426 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Xbp1O35426 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Xbp1O35426 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Xbp1O35426 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Xbp1O35426 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Xbp1O35426 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Xbp1O35426 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Xbp1O35426 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Xbp1O35426 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Xbp1O35426 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Xbp1O35426 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Xbp1O35426 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Xbp1O35426 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Xbp1O35426 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Xbp1O35426 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Xbp1O35426 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Xbp1O35426 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Xbp1O35426 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Xbp1O35426 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Xbp1O35426 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Xbp1O35426 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Xbp1O35426 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Xbp1O35426 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Xbp1O35426 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Xbp1O35426 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Xbp1O35426 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Xbp1O35426 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Xbp1O35426 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Xbp1O35426 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Xbp1O35426 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Xbp1O35426 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Xbp1O35426 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Xbp1O35426 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Xbp1O35426 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Xbp1O35426 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Xbp1O35426 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Xbp1O35426 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Xbp1O35426 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Xbp1O35426 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Xbp1O35426 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Xbp1O35426 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Xbp1O35426 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Xbp1O35426 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Xbp1O35426 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Xbp1O35426 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Xbp1O35426 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Xbp1O35426 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Xbp1O35426 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Xbp1O35426 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Xbp1O35426 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Xbp1O35426 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Xbp1O35426 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Xbp1O35426 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Xbp1O35426 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Xbp1O35426 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Xbp1O35426 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Xbp1O35426 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Xbp1O35426 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Xbp1O35426 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Xbp1O35426 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Xbp1O35426 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Xbp1O35426 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Xbp1O35426 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Xbp1O35426 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Xbp1O35426 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Xbp1O35426 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Xbp1O35426 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Xbp1O35426 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Xbp1O35426 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Xbp1O35426 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Xbp1O35426 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Xbp1O35426 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Xbp1O35426 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Xbp1O35426 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Xbp1O35426 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Xbp1O35426 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Xbp1O35426 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Xbp1O35426 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Xbp1O35426 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Xbp1O35426 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Xbp1O35426 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Xbp1O35426 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Xbp1O35426 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms