Protein–RNA interactions for Protein: O35326

Srsf5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf5O35326 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Srsf5O35326 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Srsf5O35326 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Srsf5O35326 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Srsf5O35326 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Srsf5O35326 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Srsf5O35326 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Srsf5O35326 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Srsf5O35326 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Srsf5O35326 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Srsf5O35326 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Srsf5O35326 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Srsf5O35326 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Srsf5O35326 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Srsf5O35326 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Srsf5O35326 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Srsf5O35326 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Srsf5O35326 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Srsf5O35326 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Srsf5O35326 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Srsf5O35326 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Srsf5O35326 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Srsf5O35326 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Srsf5O35326 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Srsf5O35326 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Srsf5O35326 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Srsf5O35326 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Srsf5O35326 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Srsf5O35326 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Srsf5O35326 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Srsf5O35326 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Srsf5O35326 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Srsf5O35326 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Srsf5O35326 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Srsf5O35326 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Srsf5O35326 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Srsf5O35326 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Srsf5O35326 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Srsf5O35326 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Srsf5O35326 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Srsf5O35326 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Srsf5O35326 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Srsf5O35326 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Srsf5O35326 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Srsf5O35326 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Srsf5O35326 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Srsf5O35326 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Srsf5O35326 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Srsf5O35326 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Srsf5O35326 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Srsf5O35326 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Srsf5O35326 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Srsf5O35326 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Srsf5O35326 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Srsf5O35326 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Srsf5O35326 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Srsf5O35326 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Srsf5O35326 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Srsf5O35326 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Srsf5O35326 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Srsf5O35326 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Srsf5O35326 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Srsf5O35326 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Srsf5O35326 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Srsf5O35326 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Srsf5O35326 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Srsf5O35326 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Srsf5O35326 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Srsf5O35326 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Srsf5O35326 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Srsf5O35326 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Srsf5O35326 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Srsf5O35326 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Srsf5O35326 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Srsf5O35326 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Srsf5O35326 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Srsf5O35326 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Srsf5O35326 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Srsf5O35326 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Srsf5O35326 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Srsf5O35326 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Srsf5O35326 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Srsf5O35326 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Srsf5O35326 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Srsf5O35326 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Srsf5O35326 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Srsf5O35326 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Srsf5O35326 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Srsf5O35326 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Srsf5O35326 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Srsf5O35326 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Srsf5O35326 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Srsf5O35326 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Srsf5O35326 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Srsf5O35326 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Srsf5O35326 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Srsf5O35326 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Srsf5O35326 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Srsf5O35326 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Srsf5O35326 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms