Protein–RNA interactions for Protein: O35304

Slc18a3, Vesicular acetylcholine transporter, mousemouse

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc18a3O35304 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Slc18a3O35304 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Slc18a3O35304 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Slc18a3O35304 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Slc18a3O35304 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Slc18a3O35304 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Slc18a3O35304 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Slc18a3O35304 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Slc18a3O35304 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Slc18a3O35304 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Slc18a3O35304 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Slc18a3O35304 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Slc18a3O35304 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Slc18a3O35304 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Slc18a3O35304 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Slc18a3O35304 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Slc18a3O35304 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Slc18a3O35304 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Slc18a3O35304 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Slc18a3O35304 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Slc18a3O35304 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Slc18a3O35304 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Slc18a3O35304 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Slc18a3O35304 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Slc18a3O35304 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Slc18a3O35304 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Slc18a3O35304 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Slc18a3O35304 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Slc18a3O35304 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Slc18a3O35304 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Slc18a3O35304 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Slc18a3O35304 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Slc18a3O35304 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Slc18a3O35304 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Slc18a3O35304 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Slc18a3O35304 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Slc18a3O35304 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Slc18a3O35304 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Slc18a3O35304 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Slc18a3O35304 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Slc18a3O35304 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Slc18a3O35304 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Slc18a3O35304 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Slc18a3O35304 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Slc18a3O35304 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Slc18a3O35304 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Slc18a3O35304 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Slc18a3O35304 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Slc18a3O35304 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Slc18a3O35304 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Slc18a3O35304 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Slc18a3O35304 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Slc18a3O35304 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Slc18a3O35304 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Slc18a3O35304 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Slc18a3O35304 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Slc18a3O35304 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Slc18a3O35304 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Slc18a3O35304 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Slc18a3O35304 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Slc18a3O35304 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Slc18a3O35304 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Slc18a3O35304 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Slc18a3O35304 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Slc18a3O35304 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Slc18a3O35304 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Slc18a3O35304 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Slc18a3O35304 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Slc18a3O35304 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Slc18a3O35304 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Slc18a3O35304 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Slc18a3O35304 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Slc18a3O35304 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Slc18a3O35304 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Slc18a3O35304 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Slc18a3O35304 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Slc18a3O35304 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Slc18a3O35304 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Slc18a3O35304 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Slc18a3O35304 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Slc18a3O35304 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Slc18a3O35304 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Slc18a3O35304 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Slc18a3O35304 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Slc18a3O35304 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Slc18a3O35304 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Slc18a3O35304 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Slc18a3O35304 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Slc18a3O35304 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Slc18a3O35304 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Slc18a3O35304 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Slc18a3O35304 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Slc18a3O35304 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Slc18a3O35304 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Slc18a3O35304 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Slc18a3O35304 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Slc18a3O35304 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Slc18a3O35304 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Slc18a3O35304 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Slc18a3O35304 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms