Protein–RNA interactions for Protein: O35261

E2f3, Transcription factor E2F3, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f3O35261 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
E2f3O35261 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
E2f3O35261 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
E2f3O35261 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
E2f3O35261 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
E2f3O35261 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
E2f3O35261 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
E2f3O35261 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
E2f3O35261 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.03■□□□□ -0
E2f3O35261 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
E2f3O35261 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
E2f3O35261 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
E2f3O35261 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
E2f3O35261 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
E2f3O35261 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
E2f3O35261 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
E2f3O35261 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
E2f3O35261 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
E2f3O35261 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
E2f3O35261 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
E2f3O35261 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
E2f3O35261 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
E2f3O35261 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
E2f3O35261 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
E2f3O35261 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
E2f3O35261 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
E2f3O35261 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
E2f3O35261 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
E2f3O35261 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
E2f3O35261 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
E2f3O35261 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
E2f3O35261 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
E2f3O35261 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
E2f3O35261 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
E2f3O35261 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
E2f3O35261 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
E2f3O35261 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.02■□□□□ -0
E2f3O35261 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
E2f3O35261 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
E2f3O35261 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.02■□□□□ -0
E2f3O35261 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
E2f3O35261 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
E2f3O35261 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
E2f3O35261 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
E2f3O35261 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
E2f3O35261 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
E2f3O35261 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
E2f3O35261 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
E2f3O35261 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
E2f3O35261 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
E2f3O35261 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
E2f3O35261 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
E2f3O35261 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
E2f3O35261 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
E2f3O35261 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
E2f3O35261 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
E2f3O35261 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
E2f3O35261 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
E2f3O35261 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
E2f3O35261 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
E2f3O35261 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
E2f3O35261 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
E2f3O35261 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
E2f3O35261 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
E2f3O35261 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
E2f3O35261 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
E2f3O35261 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
E2f3O35261 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
E2f3O35261 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
E2f3O35261 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
E2f3O35261 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
E2f3O35261 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
E2f3O35261 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
E2f3O35261 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
E2f3O35261 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
E2f3O35261 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
E2f3O35261 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
E2f3O35261 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
E2f3O35261 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
E2f3O35261 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15□□□□□ -0.01
E2f3O35261 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15□□□□□ -0.01
E2f3O35261 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
E2f3O35261 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
E2f3O35261 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
E2f3O35261 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
E2f3O35261 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
E2f3O35261 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
E2f3O35261 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
E2f3O35261 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
E2f3O35261 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
E2f3O35261 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
E2f3O35261 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
E2f3O35261 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
E2f3O35261 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
E2f3O35261 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
E2f3O35261 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
E2f3O35261 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
E2f3O35261 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
E2f3O35261 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
E2f3O35261 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms