Protein–RNA interactions for Protein: O35182

Smad6, Mothers against decapentaplegic homolog 6, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad6O35182 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smad6O35182 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smad6O35182 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smad6O35182 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smad6O35182 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smad6O35182 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smad6O35182 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smad6O35182 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smad6O35182 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smad6O35182 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smad6O35182 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Smad6O35182 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smad6O35182 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smad6O35182 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Smad6O35182 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Smad6O35182 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Smad6O35182 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Smad6O35182 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smad6O35182 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smad6O35182 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smad6O35182 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smad6O35182 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smad6O35182 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smad6O35182 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smad6O35182 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smad6O35182 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smad6O35182 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smad6O35182 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smad6O35182 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smad6O35182 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smad6O35182 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smad6O35182 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Smad6O35182 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smad6O35182 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smad6O35182 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smad6O35182 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smad6O35182 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smad6O35182 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smad6O35182 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smad6O35182 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smad6O35182 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smad6O35182 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smad6O35182 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Smad6O35182 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smad6O35182 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smad6O35182 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smad6O35182 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smad6O35182 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smad6O35182 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smad6O35182 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smad6O35182 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smad6O35182 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smad6O35182 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smad6O35182 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smad6O35182 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smad6O35182 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Smad6O35182 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smad6O35182 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smad6O35182 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smad6O35182 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smad6O35182 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smad6O35182 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Smad6O35182 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smad6O35182 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smad6O35182 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smad6O35182 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smad6O35182 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smad6O35182 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smad6O35182 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smad6O35182 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smad6O35182 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smad6O35182 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smad6O35182 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smad6O35182 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smad6O35182 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smad6O35182 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smad6O35182 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smad6O35182 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smad6O35182 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smad6O35182 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smad6O35182 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smad6O35182 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smad6O35182 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smad6O35182 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smad6O35182 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smad6O35182 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smad6O35182 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Smad6O35182 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smad6O35182 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Smad6O35182 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smad6O35182 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smad6O35182 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smad6O35182 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Smad6O35182 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Smad6O35182 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Smad6O35182 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Smad6O35182 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Smad6O35182 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Smad6O35182 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Smad6O35182 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms