Protein–RNA interactions for Protein: O35114

Scarb2, Lysosome membrane protein 2, mousemouse

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarb2O35114 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scarb2O35114 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scarb2O35114 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scarb2O35114 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scarb2O35114 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scarb2O35114 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scarb2O35114 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scarb2O35114 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scarb2O35114 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scarb2O35114 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scarb2O35114 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scarb2O35114 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scarb2O35114 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scarb2O35114 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scarb2O35114 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scarb2O35114 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scarb2O35114 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scarb2O35114 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scarb2O35114 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Scarb2O35114 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Scarb2O35114 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scarb2O35114 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scarb2O35114 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scarb2O35114 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scarb2O35114 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Scarb2O35114 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scarb2O35114 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scarb2O35114 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scarb2O35114 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scarb2O35114 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scarb2O35114 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scarb2O35114 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scarb2O35114 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scarb2O35114 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scarb2O35114 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scarb2O35114 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scarb2O35114 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scarb2O35114 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scarb2O35114 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scarb2O35114 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scarb2O35114 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scarb2O35114 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scarb2O35114 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scarb2O35114 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Scarb2O35114 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scarb2O35114 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scarb2O35114 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scarb2O35114 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scarb2O35114 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scarb2O35114 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scarb2O35114 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scarb2O35114 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scarb2O35114 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Scarb2O35114 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Scarb2O35114 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Scarb2O35114 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Scarb2O35114 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Scarb2O35114 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Scarb2O35114 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Scarb2O35114 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Scarb2O35114 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Scarb2O35114 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Scarb2O35114 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Scarb2O35114 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Scarb2O35114 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Scarb2O35114 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Scarb2O35114 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Scarb2O35114 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Scarb2O35114 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Scarb2O35114 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Scarb2O35114 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Scarb2O35114 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Scarb2O35114 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Scarb2O35114 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Scarb2O35114 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Scarb2O35114 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Scarb2O35114 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Scarb2O35114 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Scarb2O35114 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Scarb2O35114 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Scarb2O35114 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Scarb2O35114 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Scarb2O35114 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Scarb2O35114 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Scarb2O35114 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Scarb2O35114 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Scarb2O35114 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Scarb2O35114 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Scarb2O35114 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Scarb2O35114 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Scarb2O35114 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Scarb2O35114 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Scarb2O35114 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Scarb2O35114 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Scarb2O35114 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Scarb2O35114 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Scarb2O35114 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
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