Protein–RNA interactions for Protein: L7N1W8

Vmn2r88, Vomeronasal 2, receptor 88, mousemouse

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r88L7N1W8 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn2r88L7N1W8 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn2r88L7N1W8 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn2r88L7N1W8 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn2r88L7N1W8 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn2r88L7N1W8 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn2r88L7N1W8 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn2r88L7N1W8 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn2r88L7N1W8 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn2r88L7N1W8 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn2r88L7N1W8 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn2r88L7N1W8 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn2r88L7N1W8 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn2r88L7N1W8 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn2r88L7N1W8 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn2r88L7N1W8 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn2r88L7N1W8 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn2r88L7N1W8 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn2r88L7N1W8 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn2r88L7N1W8 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn2r88L7N1W8 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn2r88L7N1W8 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn2r88L7N1W8 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn2r88L7N1W8 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn2r88L7N1W8 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn2r88L7N1W8 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn2r88L7N1W8 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn2r88L7N1W8 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn2r88L7N1W8 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn2r88L7N1W8 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn2r88L7N1W8 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn2r88L7N1W8 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn2r88L7N1W8 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn2r88L7N1W8 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn2r88L7N1W8 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn2r88L7N1W8 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn2r88L7N1W8 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn2r88L7N1W8 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn2r88L7N1W8 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn2r88L7N1W8 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn2r88L7N1W8 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn2r88L7N1W8 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn2r88L7N1W8 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn2r88L7N1W8 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn2r88L7N1W8 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn2r88L7N1W8 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn2r88L7N1W8 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn2r88L7N1W8 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn2r88L7N1W8 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn2r88L7N1W8 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn2r88L7N1W8 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn2r88L7N1W8 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn2r88L7N1W8 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn2r88L7N1W8 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn2r88L7N1W8 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn2r88L7N1W8 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn2r88L7N1W8 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn2r88L7N1W8 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn2r88L7N1W8 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn2r88L7N1W8 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn2r88L7N1W8 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn2r88L7N1W8 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn2r88L7N1W8 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn2r88L7N1W8 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn2r88L7N1W8 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn2r88L7N1W8 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn2r88L7N1W8 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn2r88L7N1W8 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn2r88L7N1W8 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn2r88L7N1W8 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn2r88L7N1W8 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn2r88L7N1W8 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn2r88L7N1W8 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn2r88L7N1W8 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn2r88L7N1W8 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn2r88L7N1W8 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn2r88L7N1W8 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn2r88L7N1W8 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn2r88L7N1W8 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn2r88L7N1W8 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn2r88L7N1W8 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn2r88L7N1W8 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn2r88L7N1W8 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn2r88L7N1W8 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn2r88L7N1W8 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn2r88L7N1W8 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn2r88L7N1W8 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn2r88L7N1W8 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn2r88L7N1W8 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn2r88L7N1W8 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn2r88L7N1W8 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn2r88L7N1W8 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn2r88L7N1W8 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn2r88L7N1W8 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn2r88L7N1W8 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn2r88L7N1W8 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn2r88L7N1W8 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn2r88L7N1W8 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn2r88L7N1W8 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn2r88L7N1W8 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms