Protein–RNA interactions for Protein: J3QPP8

Alkal1, ALK and LTK ligand 1, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alkal1J3QPP8 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Alkal1J3QPP8 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Alkal1J3QPP8 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Alkal1J3QPP8 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Alkal1J3QPP8 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Alkal1J3QPP8 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Alkal1J3QPP8 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Alkal1J3QPP8 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Alkal1J3QPP8 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Alkal1J3QPP8 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Alkal1J3QPP8 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Alkal1J3QPP8 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Alkal1J3QPP8 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Alkal1J3QPP8 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Alkal1J3QPP8 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Alkal1J3QPP8 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Alkal1J3QPP8 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Alkal1J3QPP8 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Alkal1J3QPP8 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Alkal1J3QPP8 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Alkal1J3QPP8 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Alkal1J3QPP8 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Alkal1J3QPP8 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Alkal1J3QPP8 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Alkal1J3QPP8 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Alkal1J3QPP8 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Alkal1J3QPP8 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Alkal1J3QPP8 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Alkal1J3QPP8 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Alkal1J3QPP8 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Alkal1J3QPP8 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Alkal1J3QPP8 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Alkal1J3QPP8 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Alkal1J3QPP8 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Alkal1J3QPP8 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Alkal1J3QPP8 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Alkal1J3QPP8 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Alkal1J3QPP8 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Alkal1J3QPP8 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Alkal1J3QPP8 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Alkal1J3QPP8 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Alkal1J3QPP8 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Alkal1J3QPP8 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Alkal1J3QPP8 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Alkal1J3QPP8 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Alkal1J3QPP8 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Alkal1J3QPP8 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Alkal1J3QPP8 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Alkal1J3QPP8 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Alkal1J3QPP8 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Alkal1J3QPP8 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Alkal1J3QPP8 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Alkal1J3QPP8 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Alkal1J3QPP8 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Alkal1J3QPP8 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Alkal1J3QPP8 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Alkal1J3QPP8 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Alkal1J3QPP8 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Alkal1J3QPP8 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Alkal1J3QPP8 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Alkal1J3QPP8 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Alkal1J3QPP8 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Alkal1J3QPP8 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Alkal1J3QPP8 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Alkal1J3QPP8 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Alkal1J3QPP8 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Alkal1J3QPP8 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Alkal1J3QPP8 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Alkal1J3QPP8 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Alkal1J3QPP8 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Alkal1J3QPP8 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Alkal1J3QPP8 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Alkal1J3QPP8 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Alkal1J3QPP8 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Alkal1J3QPP8 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Alkal1J3QPP8 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Alkal1J3QPP8 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Alkal1J3QPP8 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Alkal1J3QPP8 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Alkal1J3QPP8 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Alkal1J3QPP8 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Alkal1J3QPP8 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Alkal1J3QPP8 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Alkal1J3QPP8 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Alkal1J3QPP8 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Alkal1J3QPP8 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Alkal1J3QPP8 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Alkal1J3QPP8 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Alkal1J3QPP8 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Alkal1J3QPP8 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Alkal1J3QPP8 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Alkal1J3QPP8 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Alkal1J3QPP8 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Alkal1J3QPP8 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Alkal1J3QPP8 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Alkal1J3QPP8 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Alkal1J3QPP8 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Alkal1J3QPP8 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Alkal1J3QPP8 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Alkal1J3QPP8 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.6 ms