Protein–RNA interactions for Protein: J3QNF7

Gm17577, Predicted gene, 17467, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17577J3QNF7 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm17577J3QNF7 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm17577J3QNF7 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm17577J3QNF7 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm17577J3QNF7 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm17577J3QNF7 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm17577J3QNF7 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm17577J3QNF7 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm17577J3QNF7 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm17577J3QNF7 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm17577J3QNF7 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm17577J3QNF7 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm17577J3QNF7 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm17577J3QNF7 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm17577J3QNF7 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm17577J3QNF7 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm17577J3QNF7 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm17577J3QNF7 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm17577J3QNF7 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm17577J3QNF7 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm17577J3QNF7 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm17577J3QNF7 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm17577J3QNF7 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm17577J3QNF7 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm17577J3QNF7 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm17577J3QNF7 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm17577J3QNF7 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm17577J3QNF7 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm17577J3QNF7 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm17577J3QNF7 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm17577J3QNF7 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm17577J3QNF7 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm17577J3QNF7 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm17577J3QNF7 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm17577J3QNF7 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm17577J3QNF7 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm17577J3QNF7 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm17577J3QNF7 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm17577J3QNF7 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm17577J3QNF7 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm17577J3QNF7 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm17577J3QNF7 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm17577J3QNF7 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm17577J3QNF7 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm17577J3QNF7 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm17577J3QNF7 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm17577J3QNF7 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm17577J3QNF7 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm17577J3QNF7 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm17577J3QNF7 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm17577J3QNF7 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm17577J3QNF7 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm17577J3QNF7 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm17577J3QNF7 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm17577J3QNF7 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm17577J3QNF7 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm17577J3QNF7 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm17577J3QNF7 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm17577J3QNF7 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm17577J3QNF7 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm17577J3QNF7 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm17577J3QNF7 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm17577J3QNF7 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm17577J3QNF7 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm17577J3QNF7 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm17577J3QNF7 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
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Gm17577J3QNF7 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm17577J3QNF7 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm17577J3QNF7 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm17577J3QNF7 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm17577J3QNF7 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm17577J3QNF7 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm17577J3QNF7 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm17577J3QNF7 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm17577J3QNF7 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm17577J3QNF7 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm17577J3QNF7 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm17577J3QNF7 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm17577J3QNF7 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm17577J3QNF7 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm17577J3QNF7 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm17577J3QNF7 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm17577J3QNF7 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm17577J3QNF7 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm17577J3QNF7 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm17577J3QNF7 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm17577J3QNF7 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm17577J3QNF7 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm17577J3QNF7 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm17577J3QNF7 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm17577J3QNF7 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm17577J3QNF7 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm17577J3QNF7 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm17577J3QNF7 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm17577J3QNF7 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm17577J3QNF7 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm17577J3QNF7 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm17577J3QNF7 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm17577J3QNF7 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
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