Protein–RNA interactions for Protein: J3QMI4

Calhm3, Calcium homeostasis modulator 3, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calhm3J3QMI4 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Calhm3J3QMI4 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Calhm3J3QMI4 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Calhm3J3QMI4 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Calhm3J3QMI4 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Calhm3J3QMI4 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Calhm3J3QMI4 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Calhm3J3QMI4 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Calhm3J3QMI4 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Calhm3J3QMI4 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Calhm3J3QMI4 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Calhm3J3QMI4 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Calhm3J3QMI4 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Calhm3J3QMI4 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Calhm3J3QMI4 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Calhm3J3QMI4 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Calhm3J3QMI4 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Calhm3J3QMI4 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Calhm3J3QMI4 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Calhm3J3QMI4 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Calhm3J3QMI4 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Calhm3J3QMI4 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Calhm3J3QMI4 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Calhm3J3QMI4 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Calhm3J3QMI4 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Calhm3J3QMI4 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Calhm3J3QMI4 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Calhm3J3QMI4 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Calhm3J3QMI4 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Calhm3J3QMI4 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Calhm3J3QMI4 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Calhm3J3QMI4 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Calhm3J3QMI4 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Calhm3J3QMI4 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Calhm3J3QMI4 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Calhm3J3QMI4 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Calhm3J3QMI4 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Calhm3J3QMI4 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Calhm3J3QMI4 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Calhm3J3QMI4 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Calhm3J3QMI4 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Calhm3J3QMI4 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Calhm3J3QMI4 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Calhm3J3QMI4 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Calhm3J3QMI4 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Calhm3J3QMI4 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Calhm3J3QMI4 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Calhm3J3QMI4 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Calhm3J3QMI4 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Calhm3J3QMI4 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Calhm3J3QMI4 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Calhm3J3QMI4 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Calhm3J3QMI4 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Calhm3J3QMI4 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Calhm3J3QMI4 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Calhm3J3QMI4 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Calhm3J3QMI4 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Calhm3J3QMI4 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Calhm3J3QMI4 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Calhm3J3QMI4 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Calhm3J3QMI4 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Calhm3J3QMI4 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Calhm3J3QMI4 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Calhm3J3QMI4 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Calhm3J3QMI4 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Calhm3J3QMI4 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Calhm3J3QMI4 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Calhm3J3QMI4 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Calhm3J3QMI4 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Calhm3J3QMI4 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Calhm3J3QMI4 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Calhm3J3QMI4 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Calhm3J3QMI4 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Calhm3J3QMI4 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Calhm3J3QMI4 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Calhm3J3QMI4 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Calhm3J3QMI4 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Calhm3J3QMI4 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Calhm3J3QMI4 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Calhm3J3QMI4 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Calhm3J3QMI4 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Calhm3J3QMI4 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Calhm3J3QMI4 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Calhm3J3QMI4 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Calhm3J3QMI4 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Calhm3J3QMI4 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Calhm3J3QMI4 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Calhm3J3QMI4 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Calhm3J3QMI4 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Calhm3J3QMI4 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Calhm3J3QMI4 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Calhm3J3QMI4 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Calhm3J3QMI4 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Calhm3J3QMI4 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Calhm3J3QMI4 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Calhm3J3QMI4 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Calhm3J3QMI4 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Calhm3J3QMI4 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Calhm3J3QMI4 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Calhm3J3QMI4 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms