Protein–RNA interactions for Protein: G3X9K3

Arfgef1, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,846 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfgef1G3X9K3 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Arfgef1G3X9K3 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Arfgef1G3X9K3 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Arfgef1G3X9K3 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Arfgef1G3X9K3 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Arfgef1G3X9K3 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Arfgef1G3X9K3 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Arfgef1G3X9K3 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Arfgef1G3X9K3 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Arfgef1G3X9K3 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Arfgef1G3X9K3 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Arfgef1G3X9K3 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Arfgef1G3X9K3 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Arfgef1G3X9K3 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Arfgef1G3X9K3 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Arfgef1G3X9K3 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Arfgef1G3X9K3 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Arfgef1G3X9K3 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Arfgef1G3X9K3 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Arfgef1G3X9K3 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Arfgef1G3X9K3 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Arfgef1G3X9K3 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Arfgef1G3X9K3 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Arfgef1G3X9K3 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Arfgef1G3X9K3 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Arfgef1G3X9K3 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Arfgef1G3X9K3 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Arfgef1G3X9K3 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Arfgef1G3X9K3 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Arfgef1G3X9K3 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Arfgef1G3X9K3 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Arfgef1G3X9K3 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Arfgef1G3X9K3 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Arfgef1G3X9K3 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Arfgef1G3X9K3 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Arfgef1G3X9K3 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Arfgef1G3X9K3 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Arfgef1G3X9K3 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Arfgef1G3X9K3 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Arfgef1G3X9K3 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Arfgef1G3X9K3 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Arfgef1G3X9K3 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Arfgef1G3X9K3 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Arfgef1G3X9K3 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Arfgef1G3X9K3 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Arfgef1G3X9K3 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Arfgef1G3X9K3 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Arfgef1G3X9K3 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Arfgef1G3X9K3 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Arfgef1G3X9K3 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Arfgef1G3X9K3 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Arfgef1G3X9K3 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Arfgef1G3X9K3 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Arfgef1G3X9K3 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Arfgef1G3X9K3 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Arfgef1G3X9K3 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Arfgef1G3X9K3 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Arfgef1G3X9K3 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Arfgef1G3X9K3 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Arfgef1G3X9K3 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Arfgef1G3X9K3 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Arfgef1G3X9K3 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Arfgef1G3X9K3 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Arfgef1G3X9K3 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Arfgef1G3X9K3 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Arfgef1G3X9K3 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Arfgef1G3X9K3 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Arfgef1G3X9K3 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Arfgef1G3X9K3 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Arfgef1G3X9K3 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Arfgef1G3X9K3 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Arfgef1G3X9K3 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Arfgef1G3X9K3 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Arfgef1G3X9K3 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Arfgef1G3X9K3 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Arfgef1G3X9K3 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Arfgef1G3X9K3 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Arfgef1G3X9K3 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Arfgef1G3X9K3 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Arfgef1G3X9K3 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Arfgef1G3X9K3 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Arfgef1G3X9K3 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Arfgef1G3X9K3 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Arfgef1G3X9K3 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Arfgef1G3X9K3 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Arfgef1G3X9K3 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Arfgef1G3X9K3 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Arfgef1G3X9K3 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Arfgef1G3X9K3 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Arfgef1G3X9K3 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Arfgef1G3X9K3 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Arfgef1G3X9K3 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Arfgef1G3X9K3 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Arfgef1G3X9K3 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Arfgef1G3X9K3 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Arfgef1G3X9K3 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Arfgef1G3X9K3 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Arfgef1G3X9K3 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Arfgef1G3X9K3 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Arfgef1G3X9K3 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms