Protein–RNA interactions for Protein: F8VQM2

Ccl26, Chemokine (C-C motif) ligand 26, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl26F8VQM2 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccl26F8VQM2 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccl26F8VQM2 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccl26F8VQM2 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccl26F8VQM2 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccl26F8VQM2 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccl26F8VQM2 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccl26F8VQM2 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccl26F8VQM2 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccl26F8VQM2 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccl26F8VQM2 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccl26F8VQM2 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccl26F8VQM2 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccl26F8VQM2 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccl26F8VQM2 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccl26F8VQM2 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccl26F8VQM2 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccl26F8VQM2 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccl26F8VQM2 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccl26F8VQM2 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccl26F8VQM2 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccl26F8VQM2 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccl26F8VQM2 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccl26F8VQM2 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccl26F8VQM2 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccl26F8VQM2 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccl26F8VQM2 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccl26F8VQM2 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccl26F8VQM2 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccl26F8VQM2 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccl26F8VQM2 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccl26F8VQM2 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccl26F8VQM2 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccl26F8VQM2 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccl26F8VQM2 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccl26F8VQM2 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccl26F8VQM2 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccl26F8VQM2 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccl26F8VQM2 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccl26F8VQM2 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccl26F8VQM2 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccl26F8VQM2 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccl26F8VQM2 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccl26F8VQM2 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccl26F8VQM2 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccl26F8VQM2 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccl26F8VQM2 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccl26F8VQM2 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccl26F8VQM2 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccl26F8VQM2 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccl26F8VQM2 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccl26F8VQM2 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccl26F8VQM2 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccl26F8VQM2 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccl26F8VQM2 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccl26F8VQM2 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccl26F8VQM2 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccl26F8VQM2 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Ccl26F8VQM2 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Ccl26F8VQM2 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Ccl26F8VQM2 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Ccl26F8VQM2 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccl26F8VQM2 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccl26F8VQM2 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccl26F8VQM2 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccl26F8VQM2 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccl26F8VQM2 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccl26F8VQM2 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccl26F8VQM2 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccl26F8VQM2 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccl26F8VQM2 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccl26F8VQM2 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccl26F8VQM2 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccl26F8VQM2 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccl26F8VQM2 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccl26F8VQM2 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccl26F8VQM2 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccl26F8VQM2 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccl26F8VQM2 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccl26F8VQM2 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccl26F8VQM2 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccl26F8VQM2 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccl26F8VQM2 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccl26F8VQM2 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccl26F8VQM2 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccl26F8VQM2 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccl26F8VQM2 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccl26F8VQM2 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccl26F8VQM2 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccl26F8VQM2 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccl26F8VQM2 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccl26F8VQM2 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccl26F8VQM2 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccl26F8VQM2 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccl26F8VQM2 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccl26F8VQM2 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccl26F8VQM2 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccl26F8VQM2 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccl26F8VQM2 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccl26F8VQM2 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms