Protein–RNA interactions for Protein: F6XS56

Gm8444, Predicted gene 8444, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8444F6XS56 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm8444F6XS56 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm8444F6XS56 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm8444F6XS56 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm8444F6XS56 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm8444F6XS56 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm8444F6XS56 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm8444F6XS56 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm8444F6XS56 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm8444F6XS56 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm8444F6XS56 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm8444F6XS56 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm8444F6XS56 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm8444F6XS56 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm8444F6XS56 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm8444F6XS56 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm8444F6XS56 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm8444F6XS56 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm8444F6XS56 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm8444F6XS56 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm8444F6XS56 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm8444F6XS56 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm8444F6XS56 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm8444F6XS56 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm8444F6XS56 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm8444F6XS56 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm8444F6XS56 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm8444F6XS56 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm8444F6XS56 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm8444F6XS56 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm8444F6XS56 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm8444F6XS56 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm8444F6XS56 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm8444F6XS56 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm8444F6XS56 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm8444F6XS56 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm8444F6XS56 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm8444F6XS56 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm8444F6XS56 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm8444F6XS56 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm8444F6XS56 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm8444F6XS56 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm8444F6XS56 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm8444F6XS56 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm8444F6XS56 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm8444F6XS56 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm8444F6XS56 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm8444F6XS56 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm8444F6XS56 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm8444F6XS56 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm8444F6XS56 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm8444F6XS56 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm8444F6XS56 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm8444F6XS56 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm8444F6XS56 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm8444F6XS56 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm8444F6XS56 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm8444F6XS56 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm8444F6XS56 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm8444F6XS56 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm8444F6XS56 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm8444F6XS56 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm8444F6XS56 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm8444F6XS56 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm8444F6XS56 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm8444F6XS56 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm8444F6XS56 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm8444F6XS56 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm8444F6XS56 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm8444F6XS56 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm8444F6XS56 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm8444F6XS56 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm8444F6XS56 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm8444F6XS56 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm8444F6XS56 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm8444F6XS56 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm8444F6XS56 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm8444F6XS56 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm8444F6XS56 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm8444F6XS56 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm8444F6XS56 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm8444F6XS56 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm8444F6XS56 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm8444F6XS56 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm8444F6XS56 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm8444F6XS56 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm8444F6XS56 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm8444F6XS56 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm8444F6XS56 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm8444F6XS56 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm8444F6XS56 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm8444F6XS56 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm8444F6XS56 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm8444F6XS56 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm8444F6XS56 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm8444F6XS56 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm8444F6XS56 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm8444F6XS56 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm8444F6XS56 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm8444F6XS56 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms