Protein–RNA interactions for Protein: F6TVX7

Gm20671, Predicted gene 20671 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 576 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20671F6TVX7 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm20671F6TVX7 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm20671F6TVX7 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm20671F6TVX7 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm20671F6TVX7 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm20671F6TVX7 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm20671F6TVX7 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm20671F6TVX7 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm20671F6TVX7 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm20671F6TVX7 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm20671F6TVX7 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm20671F6TVX7 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm20671F6TVX7 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm20671F6TVX7 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm20671F6TVX7 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm20671F6TVX7 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm20671F6TVX7 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm20671F6TVX7 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm20671F6TVX7 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm20671F6TVX7 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm20671F6TVX7 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm20671F6TVX7 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm20671F6TVX7 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm20671F6TVX7 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm20671F6TVX7 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm20671F6TVX7 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm20671F6TVX7 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm20671F6TVX7 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm20671F6TVX7 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm20671F6TVX7 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm20671F6TVX7 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm20671F6TVX7 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm20671F6TVX7 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm20671F6TVX7 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm20671F6TVX7 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm20671F6TVX7 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm20671F6TVX7 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm20671F6TVX7 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm20671F6TVX7 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm20671F6TVX7 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm20671F6TVX7 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm20671F6TVX7 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Gm20671F6TVX7 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm20671F6TVX7 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm20671F6TVX7 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Gm20671F6TVX7 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Gm20671F6TVX7 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Gm20671F6TVX7 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm20671F6TVX7 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm20671F6TVX7 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm20671F6TVX7 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Gm20671F6TVX7 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm20671F6TVX7 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm20671F6TVX7 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm20671F6TVX7 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm20671F6TVX7 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm20671F6TVX7 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm20671F6TVX7 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm20671F6TVX7 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm20671F6TVX7 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm20671F6TVX7 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm20671F6TVX7 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm20671F6TVX7 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm20671F6TVX7 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm20671F6TVX7 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm20671F6TVX7 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm20671F6TVX7 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm20671F6TVX7 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm20671F6TVX7 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm20671F6TVX7 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm20671F6TVX7 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm20671F6TVX7 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm20671F6TVX7 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm20671F6TVX7 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm20671F6TVX7 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm20671F6TVX7 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm20671F6TVX7 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm20671F6TVX7 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm20671F6TVX7 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm20671F6TVX7 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm20671F6TVX7 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm20671F6TVX7 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm20671F6TVX7 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm20671F6TVX7 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm20671F6TVX7 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm20671F6TVX7 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm20671F6TVX7 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm20671F6TVX7 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm20671F6TVX7 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm20671F6TVX7 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm20671F6TVX7 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm20671F6TVX7 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm20671F6TVX7 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm20671F6TVX7 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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