Protein–RNA interactions for Protein: F6SEU4

Syngap1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngap1F6SEU4 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Syngap1F6SEU4 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Syngap1F6SEU4 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Syngap1F6SEU4 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Syngap1F6SEU4 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Syngap1F6SEU4 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Syngap1F6SEU4 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Syngap1F6SEU4 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Syngap1F6SEU4 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Syngap1F6SEU4 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Syngap1F6SEU4 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Syngap1F6SEU4 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Syngap1F6SEU4 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Syngap1F6SEU4 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Syngap1F6SEU4 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Syngap1F6SEU4 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Syngap1F6SEU4 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Syngap1F6SEU4 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Syngap1F6SEU4 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Syngap1F6SEU4 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Syngap1F6SEU4 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Syngap1F6SEU4 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Syngap1F6SEU4 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Syngap1F6SEU4 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Syngap1F6SEU4 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Syngap1F6SEU4 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Syngap1F6SEU4 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Syngap1F6SEU4 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Syngap1F6SEU4 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Syngap1F6SEU4 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Syngap1F6SEU4 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Syngap1F6SEU4 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Syngap1F6SEU4 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Syngap1F6SEU4 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Syngap1F6SEU4 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Syngap1F6SEU4 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Syngap1F6SEU4 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Syngap1F6SEU4 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Syngap1F6SEU4 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Syngap1F6SEU4 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Syngap1F6SEU4 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Syngap1F6SEU4 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Syngap1F6SEU4 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Syngap1F6SEU4 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Syngap1F6SEU4 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Syngap1F6SEU4 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Syngap1F6SEU4 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Syngap1F6SEU4 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Syngap1F6SEU4 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Syngap1F6SEU4 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Syngap1F6SEU4 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Syngap1F6SEU4 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Syngap1F6SEU4 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Syngap1F6SEU4 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Syngap1F6SEU4 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Syngap1F6SEU4 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Syngap1F6SEU4 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Syngap1F6SEU4 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Syngap1F6SEU4 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Syngap1F6SEU4 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Syngap1F6SEU4 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Syngap1F6SEU4 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Syngap1F6SEU4 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Syngap1F6SEU4 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Syngap1F6SEU4 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Syngap1F6SEU4 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Syngap1F6SEU4 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Syngap1F6SEU4 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Syngap1F6SEU4 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Syngap1F6SEU4 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Syngap1F6SEU4 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Syngap1F6SEU4 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Syngap1F6SEU4 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Syngap1F6SEU4 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Syngap1F6SEU4 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Syngap1F6SEU4 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Syngap1F6SEU4 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Syngap1F6SEU4 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Syngap1F6SEU4 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Syngap1F6SEU4 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Syngap1F6SEU4 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Syngap1F6SEU4 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Syngap1F6SEU4 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Syngap1F6SEU4 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Syngap1F6SEU4 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Syngap1F6SEU4 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Syngap1F6SEU4 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Syngap1F6SEU4 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Syngap1F6SEU4 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Syngap1F6SEU4 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Syngap1F6SEU4 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Syngap1F6SEU4 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Syngap1F6SEU4 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Syngap1F6SEU4 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Syngap1F6SEU4 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Syngap1F6SEU4 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Syngap1F6SEU4 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Syngap1F6SEU4 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Syngap1F6SEU4 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Syngap1F6SEU4 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms