Protein–RNA interactions for Protein: F6RGI3

Gm340, Predicted gene 340, mousemouse

Predictions only

Length 1,242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm340F6RGI3 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm340F6RGI3 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm340F6RGI3 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gm340F6RGI3 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm340F6RGI3 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm340F6RGI3 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm340F6RGI3 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm340F6RGI3 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm340F6RGI3 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm340F6RGI3 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm340F6RGI3 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm340F6RGI3 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm340F6RGI3 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm340F6RGI3 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm340F6RGI3 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm340F6RGI3 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm340F6RGI3 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm340F6RGI3 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm340F6RGI3 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm340F6RGI3 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm340F6RGI3 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm340F6RGI3 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm340F6RGI3 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm340F6RGI3 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm340F6RGI3 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm340F6RGI3 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm340F6RGI3 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm340F6RGI3 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm340F6RGI3 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm340F6RGI3 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm340F6RGI3 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm340F6RGI3 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm340F6RGI3 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm340F6RGI3 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm340F6RGI3 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm340F6RGI3 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm340F6RGI3 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm340F6RGI3 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm340F6RGI3 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm340F6RGI3 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm340F6RGI3 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm340F6RGI3 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm340F6RGI3 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm340F6RGI3 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gm340F6RGI3 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm340F6RGI3 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gm340F6RGI3 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gm340F6RGI3 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm340F6RGI3 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm340F6RGI3 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm340F6RGI3 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm340F6RGI3 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm340F6RGI3 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm340F6RGI3 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm340F6RGI3 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm340F6RGI3 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm340F6RGI3 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm340F6RGI3 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm340F6RGI3 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm340F6RGI3 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm340F6RGI3 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Gm340F6RGI3 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Gm340F6RGI3 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm340F6RGI3 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm340F6RGI3 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Gm340F6RGI3 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Gm340F6RGI3 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm340F6RGI3 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm340F6RGI3 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Gm340F6RGI3 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Gm340F6RGI3 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Gm340F6RGI3 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Gm340F6RGI3 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm340F6RGI3 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm340F6RGI3 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm340F6RGI3 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm340F6RGI3 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm340F6RGI3 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm340F6RGI3 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm340F6RGI3 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm340F6RGI3 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm340F6RGI3 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm340F6RGI3 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm340F6RGI3 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm340F6RGI3 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm340F6RGI3 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm340F6RGI3 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm340F6RGI3 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm340F6RGI3 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm340F6RGI3 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm340F6RGI3 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm340F6RGI3 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm340F6RGI3 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm340F6RGI3 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm340F6RGI3 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm340F6RGI3 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm340F6RGI3 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm340F6RGI3 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm340F6RGI3 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm340F6RGI3 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms