Protein–RNA interactions for Protein: E9QAP7

Taf4, TATA-box-binding protein-associated factor 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Taf4E9QAP7 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Taf4E9QAP7 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Taf4E9QAP7 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Taf4E9QAP7 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Taf4E9QAP7 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Taf4E9QAP7 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Taf4E9QAP7 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Taf4E9QAP7 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Taf4E9QAP7 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Taf4E9QAP7 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Taf4E9QAP7 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Taf4E9QAP7 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Taf4E9QAP7 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Taf4E9QAP7 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Taf4E9QAP7 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Taf4E9QAP7 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Taf4E9QAP7 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Taf4E9QAP7 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Taf4E9QAP7 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Taf4E9QAP7 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Taf4E9QAP7 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Taf4E9QAP7 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Taf4E9QAP7 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Taf4E9QAP7 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Taf4E9QAP7 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Taf4E9QAP7 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Taf4E9QAP7 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Taf4E9QAP7 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Taf4E9QAP7 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Taf4E9QAP7 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Taf4E9QAP7 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Taf4E9QAP7 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Taf4E9QAP7 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Taf4E9QAP7 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Taf4E9QAP7 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Taf4E9QAP7 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms