Protein–RNA interactions for Protein: E9QA62

Lmod3, Leiomodin-3, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod3E9QA62 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lmod3E9QA62 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lmod3E9QA62 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lmod3E9QA62 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lmod3E9QA62 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lmod3E9QA62 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lmod3E9QA62 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lmod3E9QA62 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lmod3E9QA62 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lmod3E9QA62 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lmod3E9QA62 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lmod3E9QA62 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lmod3E9QA62 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lmod3E9QA62 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lmod3E9QA62 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lmod3E9QA62 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lmod3E9QA62 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lmod3E9QA62 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lmod3E9QA62 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lmod3E9QA62 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lmod3E9QA62 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lmod3E9QA62 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Lmod3E9QA62 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lmod3E9QA62 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Lmod3E9QA62 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lmod3E9QA62 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lmod3E9QA62 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lmod3E9QA62 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lmod3E9QA62 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lmod3E9QA62 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Lmod3E9QA62 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lmod3E9QA62 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Lmod3E9QA62 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lmod3E9QA62 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lmod3E9QA62 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lmod3E9QA62 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lmod3E9QA62 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lmod3E9QA62 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lmod3E9QA62 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lmod3E9QA62 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lmod3E9QA62 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lmod3E9QA62 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lmod3E9QA62 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lmod3E9QA62 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Lmod3E9QA62 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lmod3E9QA62 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lmod3E9QA62 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lmod3E9QA62 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lmod3E9QA62 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lmod3E9QA62 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lmod3E9QA62 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lmod3E9QA62 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lmod3E9QA62 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lmod3E9QA62 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lmod3E9QA62 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lmod3E9QA62 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lmod3E9QA62 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lmod3E9QA62 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lmod3E9QA62 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lmod3E9QA62 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lmod3E9QA62 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lmod3E9QA62 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lmod3E9QA62 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lmod3E9QA62 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lmod3E9QA62 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lmod3E9QA62 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lmod3E9QA62 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lmod3E9QA62 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lmod3E9QA62 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lmod3E9QA62 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lmod3E9QA62 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lmod3E9QA62 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lmod3E9QA62 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lmod3E9QA62 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lmod3E9QA62 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Lmod3E9QA62 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lmod3E9QA62 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lmod3E9QA62 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lmod3E9QA62 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lmod3E9QA62 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lmod3E9QA62 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lmod3E9QA62 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lmod3E9QA62 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lmod3E9QA62 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lmod3E9QA62 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lmod3E9QA62 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lmod3E9QA62 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lmod3E9QA62 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lmod3E9QA62 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lmod3E9QA62 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lmod3E9QA62 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lmod3E9QA62 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lmod3E9QA62 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lmod3E9QA62 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lmod3E9QA62 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lmod3E9QA62 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lmod3E9QA62 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lmod3E9QA62 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lmod3E9QA62 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lmod3E9QA62 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.2 ms