Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9Y3

Ccdc7b, Coiled-coil domain-containing 7B, mousemouse

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Length 381 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc7bE9Q9Y3 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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