Protein–RNA interactions for Protein: E9Q8F9

6030445D17Rik, RIKEN cDNA 6030445D17 gene, mousemouse

Predictions only

Length 148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
6030445D17RikE9Q8F9 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
6030445D17RikE9Q8F9 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
6030445D17RikE9Q8F9 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
6030445D17RikE9Q8F9 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
6030445D17RikE9Q8F9 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
6030445D17RikE9Q8F9 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
6030445D17RikE9Q8F9 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
6030445D17RikE9Q8F9 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
6030445D17RikE9Q8F9 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
6030445D17RikE9Q8F9 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
6030445D17RikE9Q8F9 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
6030445D17RikE9Q8F9 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
6030445D17RikE9Q8F9 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
6030445D17RikE9Q8F9 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
6030445D17RikE9Q8F9 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
6030445D17RikE9Q8F9 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
6030445D17RikE9Q8F9 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
6030445D17RikE9Q8F9 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
6030445D17RikE9Q8F9 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
6030445D17RikE9Q8F9 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
6030445D17RikE9Q8F9 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
6030445D17RikE9Q8F9 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
6030445D17RikE9Q8F9 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
6030445D17RikE9Q8F9 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
6030445D17RikE9Q8F9 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
6030445D17RikE9Q8F9 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
6030445D17RikE9Q8F9 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
6030445D17RikE9Q8F9 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC9.61□□□□□ -0.87
6030445D17RikE9Q8F9 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
6030445D17RikE9Q8F9 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
6030445D17RikE9Q8F9 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
6030445D17RikE9Q8F9 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
6030445D17RikE9Q8F9 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
6030445D17RikE9Q8F9 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
6030445D17RikE9Q8F9 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
6030445D17RikE9Q8F9 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
6030445D17RikE9Q8F9 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
6030445D17RikE9Q8F9 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
6030445D17RikE9Q8F9 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
6030445D17RikE9Q8F9 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
6030445D17RikE9Q8F9 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
6030445D17RikE9Q8F9 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
6030445D17RikE9Q8F9 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
6030445D17RikE9Q8F9 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
6030445D17RikE9Q8F9 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
6030445D17RikE9Q8F9 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
6030445D17RikE9Q8F9 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
6030445D17RikE9Q8F9 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
6030445D17RikE9Q8F9 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
6030445D17RikE9Q8F9 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
6030445D17RikE9Q8F9 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
6030445D17RikE9Q8F9 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
6030445D17RikE9Q8F9 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
6030445D17RikE9Q8F9 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
6030445D17RikE9Q8F9 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
6030445D17RikE9Q8F9 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
6030445D17RikE9Q8F9 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
6030445D17RikE9Q8F9 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
6030445D17RikE9Q8F9 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
6030445D17RikE9Q8F9 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
6030445D17RikE9Q8F9 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
6030445D17RikE9Q8F9 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC9.6□□□□□ -0.87
6030445D17RikE9Q8F9 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
6030445D17RikE9Q8F9 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
6030445D17RikE9Q8F9 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
6030445D17RikE9Q8F9 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
6030445D17RikE9Q8F9 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
6030445D17RikE9Q8F9 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
6030445D17RikE9Q8F9 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
6030445D17RikE9Q8F9 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
6030445D17RikE9Q8F9 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
6030445D17RikE9Q8F9 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
6030445D17RikE9Q8F9 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
6030445D17RikE9Q8F9 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
6030445D17RikE9Q8F9 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
6030445D17RikE9Q8F9 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
6030445D17RikE9Q8F9 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
6030445D17RikE9Q8F9 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
6030445D17RikE9Q8F9 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
6030445D17RikE9Q8F9 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
6030445D17RikE9Q8F9 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
6030445D17RikE9Q8F9 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
6030445D17RikE9Q8F9 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
6030445D17RikE9Q8F9 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
6030445D17RikE9Q8F9 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
6030445D17RikE9Q8F9 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
6030445D17RikE9Q8F9 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
6030445D17RikE9Q8F9 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
6030445D17RikE9Q8F9 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
6030445D17RikE9Q8F9 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
6030445D17RikE9Q8F9 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
6030445D17RikE9Q8F9 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
6030445D17RikE9Q8F9 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
6030445D17RikE9Q8F9 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
6030445D17RikE9Q8F9 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
6030445D17RikE9Q8F9 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
6030445D17RikE9Q8F9 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
6030445D17RikE9Q8F9 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
6030445D17RikE9Q8F9 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
6030445D17RikE9Q8F9 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms