Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5E2

BC005561, cDNA sequence BC005561, mousemouse

Predictions only

Length 1,589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC005561E9Q5E2 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BC005561E9Q5E2 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BC005561E9Q5E2 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
BC005561E9Q5E2 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BC005561E9Q5E2 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
BC005561E9Q5E2 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BC005561E9Q5E2 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
BC005561E9Q5E2 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BC005561E9Q5E2 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BC005561E9Q5E2 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BC005561E9Q5E2 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BC005561E9Q5E2 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BC005561E9Q5E2 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BC005561E9Q5E2 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BC005561E9Q5E2 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BC005561E9Q5E2 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
BC005561E9Q5E2 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BC005561E9Q5E2 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BC005561E9Q5E2 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BC005561E9Q5E2 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BC005561E9Q5E2 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BC005561E9Q5E2 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BC005561E9Q5E2 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BC005561E9Q5E2 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BC005561E9Q5E2 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BC005561E9Q5E2 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BC005561E9Q5E2 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BC005561E9Q5E2 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BC005561E9Q5E2 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BC005561E9Q5E2 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BC005561E9Q5E2 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BC005561E9Q5E2 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BC005561E9Q5E2 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BC005561E9Q5E2 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BC005561E9Q5E2 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BC005561E9Q5E2 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BC005561E9Q5E2 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BC005561E9Q5E2 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BC005561E9Q5E2 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BC005561E9Q5E2 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BC005561E9Q5E2 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BC005561E9Q5E2 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BC005561E9Q5E2 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BC005561E9Q5E2 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BC005561E9Q5E2 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BC005561E9Q5E2 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BC005561E9Q5E2 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
BC005561E9Q5E2 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BC005561E9Q5E2 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BC005561E9Q5E2 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BC005561E9Q5E2 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BC005561E9Q5E2 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BC005561E9Q5E2 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BC005561E9Q5E2 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BC005561E9Q5E2 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BC005561E9Q5E2 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BC005561E9Q5E2 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BC005561E9Q5E2 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BC005561E9Q5E2 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BC005561E9Q5E2 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BC005561E9Q5E2 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BC005561E9Q5E2 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
BC005561E9Q5E2 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BC005561E9Q5E2 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
BC005561E9Q5E2 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BC005561E9Q5E2 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BC005561E9Q5E2 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BC005561E9Q5E2 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BC005561E9Q5E2 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BC005561E9Q5E2 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BC005561E9Q5E2 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BC005561E9Q5E2 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BC005561E9Q5E2 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BC005561E9Q5E2 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BC005561E9Q5E2 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BC005561E9Q5E2 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
BC005561E9Q5E2 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BC005561E9Q5E2 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BC005561E9Q5E2 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BC005561E9Q5E2 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BC005561E9Q5E2 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BC005561E9Q5E2 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BC005561E9Q5E2 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BC005561E9Q5E2 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BC005561E9Q5E2 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BC005561E9Q5E2 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BC005561E9Q5E2 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BC005561E9Q5E2 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
BC005561E9Q5E2 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BC005561E9Q5E2 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BC005561E9Q5E2 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BC005561E9Q5E2 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BC005561E9Q5E2 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BC005561E9Q5E2 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BC005561E9Q5E2 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BC005561E9Q5E2 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BC005561E9Q5E2 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BC005561E9Q5E2 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BC005561E9Q5E2 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BC005561E9Q5E2 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms