Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3T6

Prdm14, PR domain zinc finger protein 14, mousemouse

Predictions only

Length 561 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm14E9Q3T6 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Prdm14E9Q3T6 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Prdm14E9Q3T6 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Prdm14E9Q3T6 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Prdm14E9Q3T6 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Prdm14E9Q3T6 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Prdm14E9Q3T6 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Prdm14E9Q3T6 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Prdm14E9Q3T6 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Prdm14E9Q3T6 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Prdm14E9Q3T6 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Prdm14E9Q3T6 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Prdm14E9Q3T6 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Prdm14E9Q3T6 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Prdm14E9Q3T6 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Prdm14E9Q3T6 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Prdm14E9Q3T6 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Prdm14E9Q3T6 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Prdm14E9Q3T6 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Prdm14E9Q3T6 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Prdm14E9Q3T6 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Prdm14E9Q3T6 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Prdm14E9Q3T6 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Prdm14E9Q3T6 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Prdm14E9Q3T6 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Prdm14E9Q3T6 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Prdm14E9Q3T6 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Prdm14E9Q3T6 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Prdm14E9Q3T6 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Prdm14E9Q3T6 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Prdm14E9Q3T6 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Prdm14E9Q3T6 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Prdm14E9Q3T6 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Prdm14E9Q3T6 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Prdm14E9Q3T6 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Prdm14E9Q3T6 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Prdm14E9Q3T6 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Prdm14E9Q3T6 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Prdm14E9Q3T6 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Prdm14E9Q3T6 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Prdm14E9Q3T6 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Prdm14E9Q3T6 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Prdm14E9Q3T6 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Prdm14E9Q3T6 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Prdm14E9Q3T6 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Prdm14E9Q3T6 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Prdm14E9Q3T6 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Prdm14E9Q3T6 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Prdm14E9Q3T6 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Prdm14E9Q3T6 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Prdm14E9Q3T6 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Prdm14E9Q3T6 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Prdm14E9Q3T6 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Prdm14E9Q3T6 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Prdm14E9Q3T6 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Prdm14E9Q3T6 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Prdm14E9Q3T6 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Prdm14E9Q3T6 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Prdm14E9Q3T6 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Prdm14E9Q3T6 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Prdm14E9Q3T6 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Prdm14E9Q3T6 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Prdm14E9Q3T6 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Prdm14E9Q3T6 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Prdm14E9Q3T6 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Prdm14E9Q3T6 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Prdm14E9Q3T6 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Prdm14E9Q3T6 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Prdm14E9Q3T6 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Prdm14E9Q3T6 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Prdm14E9Q3T6 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Prdm14E9Q3T6 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Prdm14E9Q3T6 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Prdm14E9Q3T6 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Prdm14E9Q3T6 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Prdm14E9Q3T6 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Prdm14E9Q3T6 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Prdm14E9Q3T6 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Prdm14E9Q3T6 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Prdm14E9Q3T6 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Prdm14E9Q3T6 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Prdm14E9Q3T6 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
Prdm14E9Q3T6 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
Prdm14E9Q3T6 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
Prdm14E9Q3T6 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Prdm14E9Q3T6 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Prdm14E9Q3T6 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Prdm14E9Q3T6 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Prdm14E9Q3T6 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Prdm14E9Q3T6 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Prdm14E9Q3T6 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Prdm14E9Q3T6 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Prdm14E9Q3T6 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Prdm14E9Q3T6 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Prdm14E9Q3T6 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Prdm14E9Q3T6 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Prdm14E9Q3T6 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Prdm14E9Q3T6 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Prdm14E9Q3T6 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Prdm14E9Q3T6 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.9 ms