Protein–RNA interactions for Protein: E9Q373

Vmn1r238, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r238E9Q373 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vmn1r238E9Q373 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vmn1r238E9Q373 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vmn1r238E9Q373 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vmn1r238E9Q373 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vmn1r238E9Q373 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vmn1r238E9Q373 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Vmn1r238E9Q373 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vmn1r238E9Q373 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vmn1r238E9Q373 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vmn1r238E9Q373 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vmn1r238E9Q373 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vmn1r238E9Q373 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vmn1r238E9Q373 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vmn1r238E9Q373 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vmn1r238E9Q373 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Vmn1r238E9Q373 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Vmn1r238E9Q373 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Vmn1r238E9Q373 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Vmn1r238E9Q373 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Vmn1r238E9Q373 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Vmn1r238E9Q373 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Vmn1r238E9Q373 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Vmn1r238E9Q373 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Vmn1r238E9Q373 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vmn1r238E9Q373 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vmn1r238E9Q373 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vmn1r238E9Q373 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vmn1r238E9Q373 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vmn1r238E9Q373 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vmn1r238E9Q373 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vmn1r238E9Q373 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vmn1r238E9Q373 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vmn1r238E9Q373 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vmn1r238E9Q373 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vmn1r238E9Q373 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vmn1r238E9Q373 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Vmn1r238E9Q373 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vmn1r238E9Q373 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vmn1r238E9Q373 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vmn1r238E9Q373 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vmn1r238E9Q373 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vmn1r238E9Q373 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vmn1r238E9Q373 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vmn1r238E9Q373 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vmn1r238E9Q373 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vmn1r238E9Q373 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vmn1r238E9Q373 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vmn1r238E9Q373 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vmn1r238E9Q373 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vmn1r238E9Q373 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vmn1r238E9Q373 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vmn1r238E9Q373 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Vmn1r238E9Q373 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vmn1r238E9Q373 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vmn1r238E9Q373 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vmn1r238E9Q373 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vmn1r238E9Q373 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vmn1r238E9Q373 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vmn1r238E9Q373 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vmn1r238E9Q373 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vmn1r238E9Q373 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Vmn1r238E9Q373 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vmn1r238E9Q373 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vmn1r238E9Q373 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vmn1r238E9Q373 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vmn1r238E9Q373 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vmn1r238E9Q373 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vmn1r238E9Q373 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vmn1r238E9Q373 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vmn1r238E9Q373 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vmn1r238E9Q373 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Vmn1r238E9Q373 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vmn1r238E9Q373 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vmn1r238E9Q373 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vmn1r238E9Q373 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vmn1r238E9Q373 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vmn1r238E9Q373 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vmn1r238E9Q373 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vmn1r238E9Q373 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vmn1r238E9Q373 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vmn1r238E9Q373 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vmn1r238E9Q373 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vmn1r238E9Q373 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vmn1r238E9Q373 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vmn1r238E9Q373 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn1r238E9Q373 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn1r238E9Q373 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn1r238E9Q373 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn1r238E9Q373 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn1r238E9Q373 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn1r238E9Q373 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn1r238E9Q373 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn1r238E9Q373 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn1r238E9Q373 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn1r238E9Q373 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn1r238E9Q373 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn1r238E9Q373 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn1r238E9Q373 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn1r238E9Q373 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms