Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ26

Brd1, Bromodomain-containing 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd1E9PZ26 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Brd1E9PZ26 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Brd1E9PZ26 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Brd1E9PZ26 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Brd1E9PZ26 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Brd1E9PZ26 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Brd1E9PZ26 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Brd1E9PZ26 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Brd1E9PZ26 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Brd1E9PZ26 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Brd1E9PZ26 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Brd1E9PZ26 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Brd1E9PZ26 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Brd1E9PZ26 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Brd1E9PZ26 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Brd1E9PZ26 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Brd1E9PZ26 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Brd1E9PZ26 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Brd1E9PZ26 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Brd1E9PZ26 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Brd1E9PZ26 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Brd1E9PZ26 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Brd1E9PZ26 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Brd1E9PZ26 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Brd1E9PZ26 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Brd1E9PZ26 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Brd1E9PZ26 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Brd1E9PZ26 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Brd1E9PZ26 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Brd1E9PZ26 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Brd1E9PZ26 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Brd1E9PZ26 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Brd1E9PZ26 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Brd1E9PZ26 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Brd1E9PZ26 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Brd1E9PZ26 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Brd1E9PZ26 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Brd1E9PZ26 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Brd1E9PZ26 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Brd1E9PZ26 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Brd1E9PZ26 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Brd1E9PZ26 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Brd1E9PZ26 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Brd1E9PZ26 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Brd1E9PZ26 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Brd1E9PZ26 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Brd1E9PZ26 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Brd1E9PZ26 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Brd1E9PZ26 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Brd1E9PZ26 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Brd1E9PZ26 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Brd1E9PZ26 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Brd1E9PZ26 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Brd1E9PZ26 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Brd1E9PZ26 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Brd1E9PZ26 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Brd1E9PZ26 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Brd1E9PZ26 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Brd1E9PZ26 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Brd1E9PZ26 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Brd1E9PZ26 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Brd1E9PZ26 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Brd1E9PZ26 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Brd1E9PZ26 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Brd1E9PZ26 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Brd1E9PZ26 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Brd1E9PZ26 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Brd1E9PZ26 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Brd1E9PZ26 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Brd1E9PZ26 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Brd1E9PZ26 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Brd1E9PZ26 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Brd1E9PZ26 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Brd1E9PZ26 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Brd1E9PZ26 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Brd1E9PZ26 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Brd1E9PZ26 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Brd1E9PZ26 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Brd1E9PZ26 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Brd1E9PZ26 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Brd1E9PZ26 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Brd1E9PZ26 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Brd1E9PZ26 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Brd1E9PZ26 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Brd1E9PZ26 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Brd1E9PZ26 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Brd1E9PZ26 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Brd1E9PZ26 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Brd1E9PZ26 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Brd1E9PZ26 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Brd1E9PZ26 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Brd1E9PZ26 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Brd1E9PZ26 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Brd1E9PZ26 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Brd1E9PZ26 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Brd1E9PZ26 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Brd1E9PZ26 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Brd1E9PZ26 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Brd1E9PZ26 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Brd1E9PZ26 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms