Protein–RNA interactions for Protein: E9PW80

Gm3298, Predicted gene 3298, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3298E9PW80 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3298E9PW80 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3298E9PW80 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3298E9PW80 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3298E9PW80 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3298E9PW80 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3298E9PW80 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3298E9PW80 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3298E9PW80 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3298E9PW80 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3298E9PW80 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3298E9PW80 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3298E9PW80 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3298E9PW80 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3298E9PW80 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm3298E9PW80 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm3298E9PW80 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm3298E9PW80 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3298E9PW80 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3298E9PW80 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3298E9PW80 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3298E9PW80 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3298E9PW80 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3298E9PW80 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3298E9PW80 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3298E9PW80 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3298E9PW80 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3298E9PW80 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3298E9PW80 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3298E9PW80 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3298E9PW80 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3298E9PW80 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3298E9PW80 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3298E9PW80 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3298E9PW80 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3298E9PW80 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3298E9PW80 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3298E9PW80 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3298E9PW80 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3298E9PW80 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3298E9PW80 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3298E9PW80 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3298E9PW80 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3298E9PW80 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3298E9PW80 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3298E9PW80 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3298E9PW80 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3298E9PW80 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3298E9PW80 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3298E9PW80 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3298E9PW80 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3298E9PW80 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3298E9PW80 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3298E9PW80 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3298E9PW80 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3298E9PW80 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3298E9PW80 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3298E9PW80 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3298E9PW80 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3298E9PW80 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3298E9PW80 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3298E9PW80 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3298E9PW80 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3298E9PW80 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3298E9PW80 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3298E9PW80 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3298E9PW80 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3298E9PW80 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3298E9PW80 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3298E9PW80 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3298E9PW80 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3298E9PW80 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3298E9PW80 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3298E9PW80 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3298E9PW80 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3298E9PW80 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3298E9PW80 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3298E9PW80 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3298E9PW80 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3298E9PW80 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3298E9PW80 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3298E9PW80 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3298E9PW80 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3298E9PW80 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3298E9PW80 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3298E9PW80 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3298E9PW80 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3298E9PW80 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3298E9PW80 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3298E9PW80 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3298E9PW80 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3298E9PW80 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3298E9PW80 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3298E9PW80 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3298E9PW80 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3298E9PW80 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3298E9PW80 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm3298E9PW80 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm3298E9PW80 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm3298E9PW80 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74 ms