Protein–RNA interactions for Protein: E9PUP1

Syde2, Synapse defective 1, Rho GTPase, homolog 2 (C. elegans), mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde2E9PUP1 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Syde2E9PUP1 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Syde2E9PUP1 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Syde2E9PUP1 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Syde2E9PUP1 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Syde2E9PUP1 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Syde2E9PUP1 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Syde2E9PUP1 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Syde2E9PUP1 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Syde2E9PUP1 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Syde2E9PUP1 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Syde2E9PUP1 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Syde2E9PUP1 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Syde2E9PUP1 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Syde2E9PUP1 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Syde2E9PUP1 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Syde2E9PUP1 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Syde2E9PUP1 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Syde2E9PUP1 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Syde2E9PUP1 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Syde2E9PUP1 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Syde2E9PUP1 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Syde2E9PUP1 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Syde2E9PUP1 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Syde2E9PUP1 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Syde2E9PUP1 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Syde2E9PUP1 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Syde2E9PUP1 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Syde2E9PUP1 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Syde2E9PUP1 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Syde2E9PUP1 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Syde2E9PUP1 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Syde2E9PUP1 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Syde2E9PUP1 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Syde2E9PUP1 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Syde2E9PUP1 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Syde2E9PUP1 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Syde2E9PUP1 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Syde2E9PUP1 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Syde2E9PUP1 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Syde2E9PUP1 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Syde2E9PUP1 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Syde2E9PUP1 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Syde2E9PUP1 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Syde2E9PUP1 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Syde2E9PUP1 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Syde2E9PUP1 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Syde2E9PUP1 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Syde2E9PUP1 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Syde2E9PUP1 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Syde2E9PUP1 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Syde2E9PUP1 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Syde2E9PUP1 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Syde2E9PUP1 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Syde2E9PUP1 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Syde2E9PUP1 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Syde2E9PUP1 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Syde2E9PUP1 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Syde2E9PUP1 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Syde2E9PUP1 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Syde2E9PUP1 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Syde2E9PUP1 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Syde2E9PUP1 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Syde2E9PUP1 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Syde2E9PUP1 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Syde2E9PUP1 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Syde2E9PUP1 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Syde2E9PUP1 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Syde2E9PUP1 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Syde2E9PUP1 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Syde2E9PUP1 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Syde2E9PUP1 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Syde2E9PUP1 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Syde2E9PUP1 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Syde2E9PUP1 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Syde2E9PUP1 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Syde2E9PUP1 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Syde2E9PUP1 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Syde2E9PUP1 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Syde2E9PUP1 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Syde2E9PUP1 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Syde2E9PUP1 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Syde2E9PUP1 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Syde2E9PUP1 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Syde2E9PUP1 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Syde2E9PUP1 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Syde2E9PUP1 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Syde2E9PUP1 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Syde2E9PUP1 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Syde2E9PUP1 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Syde2E9PUP1 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Syde2E9PUP1 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Syde2E9PUP1 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Syde2E9PUP1 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Syde2E9PUP1 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Syde2E9PUP1 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Syde2E9PUP1 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Syde2E9PUP1 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Syde2E9PUP1 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Syde2E9PUP1 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms