Protein–RNA interactions for Protein: E1U8D0

Soga1, Protein SOGA1, mousemouse

Predictions only

Length 1,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Soga1E1U8D0 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Soga1E1U8D0 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Soga1E1U8D0 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Soga1E1U8D0 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Soga1E1U8D0 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Soga1E1U8D0 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Soga1E1U8D0 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Soga1E1U8D0 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Soga1E1U8D0 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Soga1E1U8D0 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Soga1E1U8D0 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Soga1E1U8D0 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Soga1E1U8D0 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Soga1E1U8D0 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Soga1E1U8D0 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Soga1E1U8D0 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Soga1E1U8D0 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Soga1E1U8D0 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Soga1E1U8D0 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Soga1E1U8D0 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Soga1E1U8D0 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Soga1E1U8D0 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Soga1E1U8D0 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Soga1E1U8D0 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Soga1E1U8D0 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Soga1E1U8D0 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Soga1E1U8D0 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Soga1E1U8D0 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Soga1E1U8D0 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Soga1E1U8D0 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Soga1E1U8D0 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Soga1E1U8D0 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Soga1E1U8D0 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Soga1E1U8D0 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Soga1E1U8D0 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Soga1E1U8D0 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Soga1E1U8D0 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Soga1E1U8D0 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Soga1E1U8D0 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Soga1E1U8D0 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Soga1E1U8D0 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Soga1E1U8D0 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Soga1E1U8D0 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Soga1E1U8D0 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Soga1E1U8D0 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Soga1E1U8D0 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Soga1E1U8D0 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Soga1E1U8D0 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Soga1E1U8D0 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Soga1E1U8D0 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Soga1E1U8D0 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Soga1E1U8D0 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Soga1E1U8D0 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Soga1E1U8D0 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Soga1E1U8D0 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Soga1E1U8D0 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Soga1E1U8D0 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Soga1E1U8D0 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Soga1E1U8D0 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Soga1E1U8D0 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Soga1E1U8D0 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Soga1E1U8D0 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Soga1E1U8D0 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Soga1E1U8D0 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Soga1E1U8D0 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Soga1E1U8D0 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Soga1E1U8D0 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Soga1E1U8D0 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Soga1E1U8D0 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Soga1E1U8D0 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Soga1E1U8D0 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Soga1E1U8D0 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Soga1E1U8D0 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Soga1E1U8D0 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Soga1E1U8D0 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Soga1E1U8D0 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Soga1E1U8D0 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Soga1E1U8D0 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Soga1E1U8D0 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Soga1E1U8D0 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Soga1E1U8D0 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Soga1E1U8D0 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Soga1E1U8D0 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Soga1E1U8D0 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Soga1E1U8D0 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Soga1E1U8D0 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Soga1E1U8D0 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Soga1E1U8D0 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Soga1E1U8D0 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Soga1E1U8D0 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Soga1E1U8D0 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Soga1E1U8D0 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Soga1E1U8D0 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Soga1E1U8D0 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Soga1E1U8D0 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Soga1E1U8D0 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Soga1E1U8D0 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Soga1E1U8D0 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Soga1E1U8D0 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Soga1E1U8D0 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms