Protein–RNA interactions for Protein: E1AZ71

Cngb1, Cyclic nucleotide-gated channel beta 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cngb1E1AZ71 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cngb1E1AZ71 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cngb1E1AZ71 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cngb1E1AZ71 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Cngb1E1AZ71 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Cngb1E1AZ71 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Cngb1E1AZ71 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
Cngb1E1AZ71 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Cngb1E1AZ71 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Cngb1E1AZ71 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Cngb1E1AZ71 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Cngb1E1AZ71 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Cngb1E1AZ71 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
Cngb1E1AZ71 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
Cngb1E1AZ71 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Cngb1E1AZ71 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Cngb1E1AZ71 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Cngb1E1AZ71 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Cngb1E1AZ71 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Cngb1E1AZ71 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Cngb1E1AZ71 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Cngb1E1AZ71 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
Cngb1E1AZ71 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Cngb1E1AZ71 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Cngb1E1AZ71 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Cngb1E1AZ71 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Cngb1E1AZ71 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cngb1E1AZ71 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cngb1E1AZ71 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cngb1E1AZ71 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cngb1E1AZ71 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cngb1E1AZ71 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cngb1E1AZ71 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cngb1E1AZ71 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cngb1E1AZ71 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cngb1E1AZ71 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cngb1E1AZ71 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cngb1E1AZ71 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cngb1E1AZ71 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cngb1E1AZ71 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cngb1E1AZ71 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cngb1E1AZ71 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Cngb1E1AZ71 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cngb1E1AZ71 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Cngb1E1AZ71 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cngb1E1AZ71 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cngb1E1AZ71 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cngb1E1AZ71 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cngb1E1AZ71 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cngb1E1AZ71 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cngb1E1AZ71 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cngb1E1AZ71 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cngb1E1AZ71 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cngb1E1AZ71 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cngb1E1AZ71 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Cngb1E1AZ71 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Cngb1E1AZ71 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Cngb1E1AZ71 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cngb1E1AZ71 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cngb1E1AZ71 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cngb1E1AZ71 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cngb1E1AZ71 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cngb1E1AZ71 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cngb1E1AZ71 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cngb1E1AZ71 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cngb1E1AZ71 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cngb1E1AZ71 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cngb1E1AZ71 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cngb1E1AZ71 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cngb1E1AZ71 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cngb1E1AZ71 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cngb1E1AZ71 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cngb1E1AZ71 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cngb1E1AZ71 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cngb1E1AZ71 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cngb1E1AZ71 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cngb1E1AZ71 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cngb1E1AZ71 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cngb1E1AZ71 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cngb1E1AZ71 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cngb1E1AZ71 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cngb1E1AZ71 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cngb1E1AZ71 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cngb1E1AZ71 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cngb1E1AZ71 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cngb1E1AZ71 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cngb1E1AZ71 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cngb1E1AZ71 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cngb1E1AZ71 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cngb1E1AZ71 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cngb1E1AZ71 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cngb1E1AZ71 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cngb1E1AZ71 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cngb1E1AZ71 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cngb1E1AZ71 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cngb1E1AZ71 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cngb1E1AZ71 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cngb1E1AZ71 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cngb1E1AZ71 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cngb1E1AZ71 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms