Protein–RNA interactions for Protein: D3YZP9

Ccdc6, Coiled-coil domain-containing protein 6, mousemouse

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Length 469 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc6D3YZP9 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc6D3YZP9 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc6D3YZP9 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc6D3YZP9 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc6D3YZP9 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc6D3YZP9 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc6D3YZP9 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc6D3YZP9 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc6D3YZP9 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc6D3YZP9 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc6D3YZP9 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc6D3YZP9 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc6D3YZP9 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc6D3YZP9 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc6D3YZP9 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc6D3YZP9 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc6D3YZP9 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc6D3YZP9 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc6D3YZP9 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc6D3YZP9 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc6D3YZP9 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc6D3YZP9 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc6D3YZP9 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc6D3YZP9 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc6D3YZP9 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc6D3YZP9 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc6D3YZP9 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc6D3YZP9 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc6D3YZP9 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc6D3YZP9 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc6D3YZP9 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc6D3YZP9 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc6D3YZP9 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc6D3YZP9 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc6D3YZP9 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc6D3YZP9 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc6D3YZP9 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc6D3YZP9 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc6D3YZP9 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc6D3YZP9 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc6D3YZP9 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc6D3YZP9 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc6D3YZP9 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc6D3YZP9 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc6D3YZP9 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc6D3YZP9 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc6D3YZP9 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc6D3YZP9 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc6D3YZP9 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc6D3YZP9 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc6D3YZP9 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc6D3YZP9 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc6D3YZP9 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc6D3YZP9 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc6D3YZP9 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc6D3YZP9 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc6D3YZP9 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc6D3YZP9 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc6D3YZP9 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc6D3YZP9 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc6D3YZP9 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc6D3YZP9 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc6D3YZP9 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc6D3YZP9 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc6D3YZP9 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc6D3YZP9 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc6D3YZP9 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc6D3YZP9 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc6D3YZP9 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc6D3YZP9 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc6D3YZP9 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc6D3YZP9 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc6D3YZP9 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc6D3YZP9 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc6D3YZP9 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc6D3YZP9 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc6D3YZP9 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc6D3YZP9 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc6D3YZP9 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc6D3YZP9 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc6D3YZP9 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc6D3YZP9 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc6D3YZP9 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc6D3YZP9 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc6D3YZP9 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc6D3YZP9 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc6D3YZP9 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc6D3YZP9 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc6D3YZP9 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc6D3YZP9 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc6D3YZP9 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc6D3YZP9 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc6D3YZP9 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc6D3YZP9 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc6D3YZP9 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ccdc6D3YZP9 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ccdc6D3YZP9 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ccdc6D3YZP9 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ccdc6D3YZP9 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ccdc6D3YZP9 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
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