Protein–RNA interactions for Protein: D3YXL0

Ccdc170, Coiled-coil domain-containing 170, mousemouse

Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc170D3YXL0 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc170D3YXL0 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc170D3YXL0 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc170D3YXL0 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc170D3YXL0 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc170D3YXL0 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc170D3YXL0 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc170D3YXL0 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc170D3YXL0 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc170D3YXL0 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc170D3YXL0 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc170D3YXL0 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc170D3YXL0 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc170D3YXL0 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc170D3YXL0 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc170D3YXL0 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc170D3YXL0 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc170D3YXL0 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc170D3YXL0 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc170D3YXL0 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc170D3YXL0 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc170D3YXL0 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc170D3YXL0 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc170D3YXL0 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc170D3YXL0 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc170D3YXL0 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc170D3YXL0 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc170D3YXL0 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc170D3YXL0 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc170D3YXL0 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc170D3YXL0 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc170D3YXL0 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc170D3YXL0 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc170D3YXL0 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc170D3YXL0 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc170D3YXL0 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc170D3YXL0 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc170D3YXL0 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc170D3YXL0 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc170D3YXL0 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc170D3YXL0 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc170D3YXL0 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc170D3YXL0 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc170D3YXL0 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc170D3YXL0 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc170D3YXL0 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc170D3YXL0 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc170D3YXL0 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc170D3YXL0 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc170D3YXL0 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc170D3YXL0 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc170D3YXL0 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc170D3YXL0 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc170D3YXL0 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc170D3YXL0 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc170D3YXL0 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc170D3YXL0 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc170D3YXL0 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc170D3YXL0 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc170D3YXL0 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc170D3YXL0 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc170D3YXL0 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc170D3YXL0 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc170D3YXL0 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc170D3YXL0 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc170D3YXL0 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc170D3YXL0 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc170D3YXL0 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc170D3YXL0 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc170D3YXL0 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc170D3YXL0 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc170D3YXL0 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc170D3YXL0 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc170D3YXL0 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc170D3YXL0 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc170D3YXL0 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc170D3YXL0 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc170D3YXL0 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc170D3YXL0 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc170D3YXL0 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc170D3YXL0 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc170D3YXL0 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc170D3YXL0 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc170D3YXL0 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc170D3YXL0 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc170D3YXL0 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc170D3YXL0 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc170D3YXL0 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc170D3YXL0 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc170D3YXL0 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc170D3YXL0 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc170D3YXL0 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc170D3YXL0 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc170D3YXL0 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc170D3YXL0 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc170D3YXL0 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc170D3YXL0 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc170D3YXL0 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc170D3YXL0 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc170D3YXL0 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms