Protein–RNA interactions for Protein: D3YWC7

Fam47e, Family with sequence similarity 47, member E, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam47eD3YWC7 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam47eD3YWC7 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam47eD3YWC7 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam47eD3YWC7 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam47eD3YWC7 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam47eD3YWC7 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam47eD3YWC7 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam47eD3YWC7 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam47eD3YWC7 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam47eD3YWC7 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam47eD3YWC7 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam47eD3YWC7 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam47eD3YWC7 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam47eD3YWC7 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam47eD3YWC7 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam47eD3YWC7 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam47eD3YWC7 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam47eD3YWC7 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam47eD3YWC7 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam47eD3YWC7 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam47eD3YWC7 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam47eD3YWC7 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam47eD3YWC7 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam47eD3YWC7 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam47eD3YWC7 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam47eD3YWC7 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam47eD3YWC7 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam47eD3YWC7 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam47eD3YWC7 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam47eD3YWC7 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam47eD3YWC7 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam47eD3YWC7 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam47eD3YWC7 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam47eD3YWC7 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam47eD3YWC7 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam47eD3YWC7 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam47eD3YWC7 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam47eD3YWC7 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam47eD3YWC7 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam47eD3YWC7 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam47eD3YWC7 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam47eD3YWC7 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam47eD3YWC7 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam47eD3YWC7 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Fam47eD3YWC7 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Fam47eD3YWC7 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Fam47eD3YWC7 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Fam47eD3YWC7 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Fam47eD3YWC7 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Fam47eD3YWC7 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Fam47eD3YWC7 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fam47eD3YWC7 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fam47eD3YWC7 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fam47eD3YWC7 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fam47eD3YWC7 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fam47eD3YWC7 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fam47eD3YWC7 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fam47eD3YWC7 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fam47eD3YWC7 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fam47eD3YWC7 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fam47eD3YWC7 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fam47eD3YWC7 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fam47eD3YWC7 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fam47eD3YWC7 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fam47eD3YWC7 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fam47eD3YWC7 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fam47eD3YWC7 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fam47eD3YWC7 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fam47eD3YWC7 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fam47eD3YWC7 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fam47eD3YWC7 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fam47eD3YWC7 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fam47eD3YWC7 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fam47eD3YWC7 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fam47eD3YWC7 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fam47eD3YWC7 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fam47eD3YWC7 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fam47eD3YWC7 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fam47eD3YWC7 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fam47eD3YWC7 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fam47eD3YWC7 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fam47eD3YWC7 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fam47eD3YWC7 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Fam47eD3YWC7 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fam47eD3YWC7 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fam47eD3YWC7 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fam47eD3YWC7 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fam47eD3YWC7 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fam47eD3YWC7 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fam47eD3YWC7 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fam47eD3YWC7 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fam47eD3YWC7 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Fam47eD3YWC7 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Fam47eD3YWC7 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Fam47eD3YWC7 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Fam47eD3YWC7 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fam47eD3YWC7 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fam47eD3YWC7 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fam47eD3YWC7 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fam47eD3YWC7 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms