Protein–RNA interactions for Protein: B9EKK6

Nxpe3, Family with sequence similarity 55, member C, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nxpe3B9EKK6 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nxpe3B9EKK6 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nxpe3B9EKK6 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nxpe3B9EKK6 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nxpe3B9EKK6 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nxpe3B9EKK6 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nxpe3B9EKK6 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nxpe3B9EKK6 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nxpe3B9EKK6 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nxpe3B9EKK6 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nxpe3B9EKK6 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nxpe3B9EKK6 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Nxpe3B9EKK6 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nxpe3B9EKK6 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nxpe3B9EKK6 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nxpe3B9EKK6 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nxpe3B9EKK6 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nxpe3B9EKK6 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nxpe3B9EKK6 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nxpe3B9EKK6 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nxpe3B9EKK6 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nxpe3B9EKK6 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nxpe3B9EKK6 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nxpe3B9EKK6 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nxpe3B9EKK6 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nxpe3B9EKK6 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nxpe3B9EKK6 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nxpe3B9EKK6 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nxpe3B9EKK6 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nxpe3B9EKK6 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nxpe3B9EKK6 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nxpe3B9EKK6 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nxpe3B9EKK6 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nxpe3B9EKK6 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nxpe3B9EKK6 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nxpe3B9EKK6 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nxpe3B9EKK6 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nxpe3B9EKK6 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nxpe3B9EKK6 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nxpe3B9EKK6 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nxpe3B9EKK6 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nxpe3B9EKK6 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nxpe3B9EKK6 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nxpe3B9EKK6 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nxpe3B9EKK6 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nxpe3B9EKK6 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Nxpe3B9EKK6 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nxpe3B9EKK6 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nxpe3B9EKK6 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nxpe3B9EKK6 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nxpe3B9EKK6 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nxpe3B9EKK6 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nxpe3B9EKK6 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nxpe3B9EKK6 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nxpe3B9EKK6 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Nxpe3B9EKK6 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nxpe3B9EKK6 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nxpe3B9EKK6 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Nxpe3B9EKK6 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nxpe3B9EKK6 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nxpe3B9EKK6 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nxpe3B9EKK6 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nxpe3B9EKK6 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nxpe3B9EKK6 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nxpe3B9EKK6 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nxpe3B9EKK6 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nxpe3B9EKK6 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nxpe3B9EKK6 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nxpe3B9EKK6 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nxpe3B9EKK6 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nxpe3B9EKK6 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nxpe3B9EKK6 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nxpe3B9EKK6 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nxpe3B9EKK6 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nxpe3B9EKK6 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nxpe3B9EKK6 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nxpe3B9EKK6 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nxpe3B9EKK6 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nxpe3B9EKK6 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Nxpe3B9EKK6 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nxpe3B9EKK6 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Nxpe3B9EKK6 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nxpe3B9EKK6 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nxpe3B9EKK6 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nxpe3B9EKK6 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nxpe3B9EKK6 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nxpe3B9EKK6 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nxpe3B9EKK6 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nxpe3B9EKK6 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nxpe3B9EKK6 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nxpe3B9EKK6 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nxpe3B9EKK6 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nxpe3B9EKK6 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nxpe3B9EKK6 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nxpe3B9EKK6 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nxpe3B9EKK6 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nxpe3B9EKK6 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nxpe3B9EKK6 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nxpe3B9EKK6 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nxpe3B9EKK6 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms