Protein–RNA interactions for Protein: B4XVQ1

Phf11b, PHD finger protein 11B, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11bB4XVQ1 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Phf11bB4XVQ1 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Phf11bB4XVQ1 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Phf11bB4XVQ1 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Phf11bB4XVQ1 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Phf11bB4XVQ1 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Phf11bB4XVQ1 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Phf11bB4XVQ1 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Phf11bB4XVQ1 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Phf11bB4XVQ1 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Phf11bB4XVQ1 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Phf11bB4XVQ1 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Phf11bB4XVQ1 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Phf11bB4XVQ1 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Phf11bB4XVQ1 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Phf11bB4XVQ1 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Phf11bB4XVQ1 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Phf11bB4XVQ1 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Phf11bB4XVQ1 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Phf11bB4XVQ1 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Phf11bB4XVQ1 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Phf11bB4XVQ1 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Phf11bB4XVQ1 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Phf11bB4XVQ1 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Phf11bB4XVQ1 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Phf11bB4XVQ1 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Phf11bB4XVQ1 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Phf11bB4XVQ1 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Phf11bB4XVQ1 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Phf11bB4XVQ1 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Phf11bB4XVQ1 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Phf11bB4XVQ1 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Phf11bB4XVQ1 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Phf11bB4XVQ1 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Phf11bB4XVQ1 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Phf11bB4XVQ1 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Phf11bB4XVQ1 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Phf11bB4XVQ1 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Phf11bB4XVQ1 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Phf11bB4XVQ1 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Phf11bB4XVQ1 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Phf11bB4XVQ1 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Phf11bB4XVQ1 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Phf11bB4XVQ1 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Phf11bB4XVQ1 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Phf11bB4XVQ1 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Phf11bB4XVQ1 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Phf11bB4XVQ1 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Phf11bB4XVQ1 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Phf11bB4XVQ1 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Phf11bB4XVQ1 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Phf11bB4XVQ1 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Phf11bB4XVQ1 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Phf11bB4XVQ1 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Phf11bB4XVQ1 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Phf11bB4XVQ1 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Phf11bB4XVQ1 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Phf11bB4XVQ1 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Phf11bB4XVQ1 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Phf11bB4XVQ1 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Phf11bB4XVQ1 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Phf11bB4XVQ1 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Phf11bB4XVQ1 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Phf11bB4XVQ1 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Phf11bB4XVQ1 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Phf11bB4XVQ1 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Phf11bB4XVQ1 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Phf11bB4XVQ1 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Phf11bB4XVQ1 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Phf11bB4XVQ1 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Phf11bB4XVQ1 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Phf11bB4XVQ1 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Phf11bB4XVQ1 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Phf11bB4XVQ1 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Phf11bB4XVQ1 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Phf11bB4XVQ1 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Phf11bB4XVQ1 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Phf11bB4XVQ1 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Phf11bB4XVQ1 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Phf11bB4XVQ1 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Phf11bB4XVQ1 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Phf11bB4XVQ1 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Phf11bB4XVQ1 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Phf11bB4XVQ1 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Phf11bB4XVQ1 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Phf11bB4XVQ1 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Phf11bB4XVQ1 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Phf11bB4XVQ1 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Phf11bB4XVQ1 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Phf11bB4XVQ1 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Phf11bB4XVQ1 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Phf11bB4XVQ1 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Phf11bB4XVQ1 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Phf11bB4XVQ1 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Phf11bB4XVQ1 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Phf11bB4XVQ1 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Phf11bB4XVQ1 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Phf11bB4XVQ1 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Phf11bB4XVQ1 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Phf11bB4XVQ1 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms