Protein–RNA interactions for Protein: B2RXQ2

Ppfia1, Ppfia1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia1B2RXQ2 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ppfia1B2RXQ2 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Ppfia1B2RXQ2 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ppfia1B2RXQ2 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ppfia1B2RXQ2 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ppfia1B2RXQ2 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ppfia1B2RXQ2 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ppfia1B2RXQ2 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ppfia1B2RXQ2 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ppfia1B2RXQ2 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ppfia1B2RXQ2 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ppfia1B2RXQ2 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ppfia1B2RXQ2 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ppfia1B2RXQ2 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ppfia1B2RXQ2 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ppfia1B2RXQ2 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ppfia1B2RXQ2 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ppfia1B2RXQ2 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ppfia1B2RXQ2 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ppfia1B2RXQ2 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ppfia1B2RXQ2 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ppfia1B2RXQ2 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ppfia1B2RXQ2 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ppfia1B2RXQ2 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ppfia1B2RXQ2 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ppfia1B2RXQ2 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ppfia1B2RXQ2 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ppfia1B2RXQ2 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ppfia1B2RXQ2 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ppfia1B2RXQ2 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ppfia1B2RXQ2 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ppfia1B2RXQ2 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ppfia1B2RXQ2 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ppfia1B2RXQ2 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ppfia1B2RXQ2 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ppfia1B2RXQ2 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ppfia1B2RXQ2 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ppfia1B2RXQ2 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ppfia1B2RXQ2 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ppfia1B2RXQ2 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ppfia1B2RXQ2 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ppfia1B2RXQ2 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ppfia1B2RXQ2 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ppfia1B2RXQ2 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ppfia1B2RXQ2 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ppfia1B2RXQ2 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ppfia1B2RXQ2 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ppfia1B2RXQ2 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ppfia1B2RXQ2 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ppfia1B2RXQ2 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ppfia1B2RXQ2 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ppfia1B2RXQ2 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ppfia1B2RXQ2 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ppfia1B2RXQ2 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ppfia1B2RXQ2 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ppfia1B2RXQ2 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ppfia1B2RXQ2 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ppfia1B2RXQ2 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ppfia1B2RXQ2 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ppfia1B2RXQ2 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ppfia1B2RXQ2 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ppfia1B2RXQ2 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ppfia1B2RXQ2 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ppfia1B2RXQ2 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ppfia1B2RXQ2 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ppfia1B2RXQ2 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ppfia1B2RXQ2 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ppfia1B2RXQ2 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ppfia1B2RXQ2 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ppfia1B2RXQ2 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ppfia1B2RXQ2 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ppfia1B2RXQ2 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ppfia1B2RXQ2 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ppfia1B2RXQ2 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ppfia1B2RXQ2 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ppfia1B2RXQ2 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ppfia1B2RXQ2 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ppfia1B2RXQ2 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ppfia1B2RXQ2 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ppfia1B2RXQ2 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ppfia1B2RXQ2 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ppfia1B2RXQ2 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ppfia1B2RXQ2 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ppfia1B2RXQ2 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ppfia1B2RXQ2 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ppfia1B2RXQ2 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ppfia1B2RXQ2 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ppfia1B2RXQ2 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ppfia1B2RXQ2 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ppfia1B2RXQ2 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ppfia1B2RXQ2 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ppfia1B2RXQ2 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ppfia1B2RXQ2 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ppfia1B2RXQ2 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Ppfia1B2RXQ2 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ppfia1B2RXQ2 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ppfia1B2RXQ2 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ppfia1B2RXQ2 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ppfia1B2RXQ2 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ppfia1B2RXQ2 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms