Protein–RNA interactions for Protein: B2RS91

Rrn3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, mousemouse

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Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrn3B2RS91 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rrn3B2RS91 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rrn3B2RS91 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rrn3B2RS91 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rrn3B2RS91 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rrn3B2RS91 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rrn3B2RS91 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rrn3B2RS91 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rrn3B2RS91 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rrn3B2RS91 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rrn3B2RS91 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rrn3B2RS91 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rrn3B2RS91 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rrn3B2RS91 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rrn3B2RS91 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rrn3B2RS91 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rrn3B2RS91 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rrn3B2RS91 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rrn3B2RS91 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rrn3B2RS91 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rrn3B2RS91 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rrn3B2RS91 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rrn3B2RS91 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rrn3B2RS91 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rrn3B2RS91 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rrn3B2RS91 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rrn3B2RS91 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rrn3B2RS91 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rrn3B2RS91 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rrn3B2RS91 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rrn3B2RS91 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rrn3B2RS91 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rrn3B2RS91 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rrn3B2RS91 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rrn3B2RS91 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rrn3B2RS91 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rrn3B2RS91 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rrn3B2RS91 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rrn3B2RS91 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rrn3B2RS91 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rrn3B2RS91 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rrn3B2RS91 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rrn3B2RS91 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rrn3B2RS91 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rrn3B2RS91 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rrn3B2RS91 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rrn3B2RS91 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rrn3B2RS91 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rrn3B2RS91 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rrn3B2RS91 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rrn3B2RS91 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rrn3B2RS91 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rrn3B2RS91 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rrn3B2RS91 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rrn3B2RS91 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rrn3B2RS91 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rrn3B2RS91 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rrn3B2RS91 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rrn3B2RS91 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rrn3B2RS91 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rrn3B2RS91 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rrn3B2RS91 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rrn3B2RS91 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rrn3B2RS91 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rrn3B2RS91 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rrn3B2RS91 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rrn3B2RS91 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rrn3B2RS91 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rrn3B2RS91 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rrn3B2RS91 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rrn3B2RS91 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rrn3B2RS91 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rrn3B2RS91 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rrn3B2RS91 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rrn3B2RS91 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rrn3B2RS91 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rrn3B2RS91 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rrn3B2RS91 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rrn3B2RS91 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rrn3B2RS91 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rrn3B2RS91 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rrn3B2RS91 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rrn3B2RS91 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rrn3B2RS91 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rrn3B2RS91 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rrn3B2RS91 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rrn3B2RS91 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rrn3B2RS91 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rrn3B2RS91 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rrn3B2RS91 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rrn3B2RS91 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rrn3B2RS91 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rrn3B2RS91 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rrn3B2RS91 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rrn3B2RS91 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rrn3B2RS91 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rrn3B2RS91 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rrn3B2RS91 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rrn3B2RS91 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rrn3B2RS91 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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