Protein–RNA interactions for Protein: B2RRD7

Brpf1, Peregrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf1B2RRD7 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Brpf1B2RRD7 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Brpf1B2RRD7 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Brpf1B2RRD7 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Brpf1B2RRD7 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Brpf1B2RRD7 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Brpf1B2RRD7 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Brpf1B2RRD7 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Brpf1B2RRD7 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Brpf1B2RRD7 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Brpf1B2RRD7 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Brpf1B2RRD7 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Brpf1B2RRD7 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Brpf1B2RRD7 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Brpf1B2RRD7 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Brpf1B2RRD7 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Brpf1B2RRD7 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Brpf1B2RRD7 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Brpf1B2RRD7 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Brpf1B2RRD7 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Brpf1B2RRD7 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Brpf1B2RRD7 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Brpf1B2RRD7 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Brpf1B2RRD7 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Brpf1B2RRD7 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Brpf1B2RRD7 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Brpf1B2RRD7 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Brpf1B2RRD7 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Brpf1B2RRD7 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Brpf1B2RRD7 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Brpf1B2RRD7 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Brpf1B2RRD7 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Brpf1B2RRD7 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Brpf1B2RRD7 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Brpf1B2RRD7 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Brpf1B2RRD7 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Brpf1B2RRD7 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Brpf1B2RRD7 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Brpf1B2RRD7 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Brpf1B2RRD7 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Brpf1B2RRD7 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Brpf1B2RRD7 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Brpf1B2RRD7 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Brpf1B2RRD7 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Brpf1B2RRD7 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Brpf1B2RRD7 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Brpf1B2RRD7 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Brpf1B2RRD7 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Brpf1B2RRD7 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Brpf1B2RRD7 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Brpf1B2RRD7 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Brpf1B2RRD7 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Brpf1B2RRD7 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Brpf1B2RRD7 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Brpf1B2RRD7 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Brpf1B2RRD7 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Brpf1B2RRD7 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Brpf1B2RRD7 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Brpf1B2RRD7 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Brpf1B2RRD7 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Brpf1B2RRD7 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Brpf1B2RRD7 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Brpf1B2RRD7 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Brpf1B2RRD7 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Brpf1B2RRD7 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Brpf1B2RRD7 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Brpf1B2RRD7 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Brpf1B2RRD7 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Brpf1B2RRD7 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Brpf1B2RRD7 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Brpf1B2RRD7 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Brpf1B2RRD7 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Brpf1B2RRD7 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Brpf1B2RRD7 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Brpf1B2RRD7 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Brpf1B2RRD7 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Brpf1B2RRD7 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Brpf1B2RRD7 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Brpf1B2RRD7 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Brpf1B2RRD7 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Brpf1B2RRD7 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Brpf1B2RRD7 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Brpf1B2RRD7 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Brpf1B2RRD7 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Brpf1B2RRD7 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Brpf1B2RRD7 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Brpf1B2RRD7 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Brpf1B2RRD7 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Brpf1B2RRD7 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Brpf1B2RRD7 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Brpf1B2RRD7 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Brpf1B2RRD7 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Brpf1B2RRD7 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Brpf1B2RRD7 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Brpf1B2RRD7 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Brpf1B2RRD7 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Brpf1B2RRD7 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Brpf1B2RRD7 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Brpf1B2RRD7 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Brpf1B2RRD7 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80 ms