Protein–RNA interactions for Protein: B1AWZ3

Nipsnap3a, Nipsnap homolog 3A, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap3aB1AWZ3 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nipsnap3aB1AWZ3 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nipsnap3aB1AWZ3 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Nipsnap3aB1AWZ3 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nipsnap3aB1AWZ3 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nipsnap3aB1AWZ3 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Nipsnap3aB1AWZ3 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nipsnap3aB1AWZ3 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Nipsnap3aB1AWZ3 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nipsnap3aB1AWZ3 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nipsnap3aB1AWZ3 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nipsnap3aB1AWZ3 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nipsnap3aB1AWZ3 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nipsnap3aB1AWZ3 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nipsnap3aB1AWZ3 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nipsnap3aB1AWZ3 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nipsnap3aB1AWZ3 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nipsnap3aB1AWZ3 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nipsnap3aB1AWZ3 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nipsnap3aB1AWZ3 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Nipsnap3aB1AWZ3 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nipsnap3aB1AWZ3 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nipsnap3aB1AWZ3 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nipsnap3aB1AWZ3 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nipsnap3aB1AWZ3 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nipsnap3aB1AWZ3 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nipsnap3aB1AWZ3 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nipsnap3aB1AWZ3 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nipsnap3aB1AWZ3 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nipsnap3aB1AWZ3 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nipsnap3aB1AWZ3 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nipsnap3aB1AWZ3 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Nipsnap3aB1AWZ3 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nipsnap3aB1AWZ3 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Nipsnap3aB1AWZ3 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nipsnap3aB1AWZ3 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nipsnap3aB1AWZ3 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nipsnap3aB1AWZ3 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nipsnap3aB1AWZ3 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nipsnap3aB1AWZ3 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nipsnap3aB1AWZ3 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nipsnap3aB1AWZ3 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nipsnap3aB1AWZ3 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nipsnap3aB1AWZ3 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nipsnap3aB1AWZ3 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nipsnap3aB1AWZ3 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nipsnap3aB1AWZ3 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nipsnap3aB1AWZ3 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nipsnap3aB1AWZ3 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nipsnap3aB1AWZ3 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nipsnap3aB1AWZ3 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nipsnap3aB1AWZ3 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nipsnap3aB1AWZ3 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nipsnap3aB1AWZ3 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nipsnap3aB1AWZ3 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nipsnap3aB1AWZ3 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nipsnap3aB1AWZ3 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nipsnap3aB1AWZ3 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nipsnap3aB1AWZ3 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nipsnap3aB1AWZ3 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nipsnap3aB1AWZ3 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nipsnap3aB1AWZ3 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nipsnap3aB1AWZ3 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nipsnap3aB1AWZ3 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nipsnap3aB1AWZ3 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nipsnap3aB1AWZ3 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nipsnap3aB1AWZ3 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nipsnap3aB1AWZ3 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nipsnap3aB1AWZ3 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nipsnap3aB1AWZ3 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nipsnap3aB1AWZ3 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nipsnap3aB1AWZ3 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nipsnap3aB1AWZ3 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nipsnap3aB1AWZ3 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nipsnap3aB1AWZ3 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nipsnap3aB1AWZ3 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nipsnap3aB1AWZ3 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nipsnap3aB1AWZ3 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nipsnap3aB1AWZ3 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nipsnap3aB1AWZ3 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nipsnap3aB1AWZ3 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nipsnap3aB1AWZ3 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nipsnap3aB1AWZ3 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nipsnap3aB1AWZ3 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nipsnap3aB1AWZ3 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nipsnap3aB1AWZ3 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms