Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Grik3B1AS29 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Grik3B1AS29 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Grik3B1AS29 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Grik3B1AS29 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Grik3B1AS29 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Grik3B1AS29 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Grik3B1AS29 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Grik3B1AS29 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Grik3B1AS29 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Grik3B1AS29 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Grik3B1AS29 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Grik3B1AS29 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Grik3B1AS29 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Grik3B1AS29 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Grik3B1AS29 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Grik3B1AS29 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Grik3B1AS29 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Grik3B1AS29 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Grik3B1AS29 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Grik3B1AS29 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Grik3B1AS29 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Grik3B1AS29 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Grik3B1AS29 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Grik3B1AS29 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Grik3B1AS29 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Grik3B1AS29 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Grik3B1AS29 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Grik3B1AS29 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Grik3B1AS29 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Grik3B1AS29 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Grik3B1AS29 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Grik3B1AS29 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Grik3B1AS29 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Grik3B1AS29 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Grik3B1AS29 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Grik3B1AS29 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Grik3B1AS29 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Grik3B1AS29 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Grik3B1AS29 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Grik3B1AS29 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Grik3B1AS29 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Grik3B1AS29 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Grik3B1AS29 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Grik3B1AS29 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Grik3B1AS29 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Grik3B1AS29 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Grik3B1AS29 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Grik3B1AS29 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Grik3B1AS29 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Grik3B1AS29 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Grik3B1AS29 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Grik3B1AS29 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Grik3B1AS29 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Grik3B1AS29 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Grik3B1AS29 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Grik3B1AS29 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Grik3B1AS29 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Grik3B1AS29 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Grik3B1AS29 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Grik3B1AS29 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Grik3B1AS29 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Grik3B1AS29 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Grik3B1AS29 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Grik3B1AS29 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Grik3B1AS29 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Grik3B1AS29 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Grik3B1AS29 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Grik3B1AS29 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Grik3B1AS29 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Grik3B1AS29 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Grik3B1AS29 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Grik3B1AS29 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Grik3B1AS29 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Grik3B1AS29 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Grik3B1AS29 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Grik3B1AS29 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Grik3B1AS29 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Grik3B1AS29 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Grik3B1AS29 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Grik3B1AS29 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Grik3B1AS29 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Grik3B1AS29 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Grik3B1AS29 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Grik3B1AS29 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Grik3B1AS29 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Grik3B1AS29 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Grik3B1AS29 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Grik3B1AS29 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Grik3B1AS29 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Grik3B1AS29 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Grik3B1AS29 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Grik3B1AS29 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Grik3B1AS29 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Grik3B1AS29 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Grik3B1AS29 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Grik3B1AS29 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Grik3B1AS29 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Grik3B1AS29 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Grik3B1AS29 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms