Protein–RNA interactions for Protein: A9JSM3

Tmem238, Transmembrane protein 238, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem238A9JSM3 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmem238A9JSM3 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmem238A9JSM3 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmem238A9JSM3 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmem238A9JSM3 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmem238A9JSM3 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem238A9JSM3 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem238A9JSM3 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem238A9JSM3 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem238A9JSM3 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem238A9JSM3 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem238A9JSM3 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem238A9JSM3 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem238A9JSM3 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem238A9JSM3 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem238A9JSM3 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem238A9JSM3 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem238A9JSM3 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem238A9JSM3 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem238A9JSM3 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem238A9JSM3 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem238A9JSM3 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem238A9JSM3 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem238A9JSM3 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem238A9JSM3 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem238A9JSM3 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem238A9JSM3 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem238A9JSM3 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem238A9JSM3 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem238A9JSM3 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem238A9JSM3 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem238A9JSM3 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem238A9JSM3 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem238A9JSM3 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem238A9JSM3 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem238A9JSM3 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem238A9JSM3 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem238A9JSM3 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem238A9JSM3 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem238A9JSM3 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem238A9JSM3 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem238A9JSM3 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem238A9JSM3 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem238A9JSM3 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem238A9JSM3 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem238A9JSM3 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem238A9JSM3 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem238A9JSM3 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem238A9JSM3 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem238A9JSM3 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem238A9JSM3 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem238A9JSM3 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem238A9JSM3 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem238A9JSM3 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem238A9JSM3 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem238A9JSM3 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem238A9JSM3 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem238A9JSM3 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem238A9JSM3 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem238A9JSM3 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem238A9JSM3 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem238A9JSM3 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem238A9JSM3 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem238A9JSM3 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem238A9JSM3 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem238A9JSM3 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem238A9JSM3 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem238A9JSM3 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem238A9JSM3 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem238A9JSM3 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem238A9JSM3 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem238A9JSM3 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem238A9JSM3 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem238A9JSM3 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem238A9JSM3 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem238A9JSM3 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem238A9JSM3 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem238A9JSM3 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem238A9JSM3 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem238A9JSM3 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem238A9JSM3 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem238A9JSM3 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem238A9JSM3 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem238A9JSM3 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Tmem238A9JSM3 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmem238A9JSM3 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmem238A9JSM3 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmem238A9JSM3 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmem238A9JSM3 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmem238A9JSM3 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmem238A9JSM3 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmem238A9JSM3 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmem238A9JSM3 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmem238A9JSM3 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmem238A9JSM3 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmem238A9JSM3 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmem238A9JSM3 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmem238A9JSM3 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmem238A9JSM3 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmem238A9JSM3 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms