Protein–RNA interactions for Protein: A7VMS3

H2-M5, Histocompatibility 2, M region locus 5, mousemouse

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Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M5A7VMS3 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
H2-M5A7VMS3 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
H2-M5A7VMS3 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
H2-M5A7VMS3 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
H2-M5A7VMS3 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
H2-M5A7VMS3 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
H2-M5A7VMS3 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
H2-M5A7VMS3 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
H2-M5A7VMS3 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
H2-M5A7VMS3 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
H2-M5A7VMS3 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
H2-M5A7VMS3 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
H2-M5A7VMS3 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
H2-M5A7VMS3 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
H2-M5A7VMS3 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
H2-M5A7VMS3 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
H2-M5A7VMS3 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
H2-M5A7VMS3 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
H2-M5A7VMS3 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
H2-M5A7VMS3 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
H2-M5A7VMS3 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
H2-M5A7VMS3 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
H2-M5A7VMS3 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
H2-M5A7VMS3 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
H2-M5A7VMS3 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
H2-M5A7VMS3 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
H2-M5A7VMS3 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
H2-M5A7VMS3 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
H2-M5A7VMS3 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
H2-M5A7VMS3 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
H2-M5A7VMS3 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
H2-M5A7VMS3 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
H2-M5A7VMS3 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
H2-M5A7VMS3 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
H2-M5A7VMS3 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
H2-M5A7VMS3 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
H2-M5A7VMS3 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
H2-M5A7VMS3 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
H2-M5A7VMS3 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
H2-M5A7VMS3 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
H2-M5A7VMS3 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
H2-M5A7VMS3 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
H2-M5A7VMS3 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
H2-M5A7VMS3 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
H2-M5A7VMS3 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
H2-M5A7VMS3 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
H2-M5A7VMS3 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
H2-M5A7VMS3 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
H2-M5A7VMS3 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
H2-M5A7VMS3 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
H2-M5A7VMS3 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
H2-M5A7VMS3 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
H2-M5A7VMS3 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
H2-M5A7VMS3 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
H2-M5A7VMS3 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
H2-M5A7VMS3 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
H2-M5A7VMS3 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
H2-M5A7VMS3 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
H2-M5A7VMS3 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
H2-M5A7VMS3 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
H2-M5A7VMS3 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
H2-M5A7VMS3 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
H2-M5A7VMS3 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
H2-M5A7VMS3 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
H2-M5A7VMS3 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
H2-M5A7VMS3 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
H2-M5A7VMS3 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
H2-M5A7VMS3 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
H2-M5A7VMS3 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
H2-M5A7VMS3 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
H2-M5A7VMS3 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
H2-M5A7VMS3 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
H2-M5A7VMS3 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
H2-M5A7VMS3 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
H2-M5A7VMS3 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
H2-M5A7VMS3 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
H2-M5A7VMS3 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
H2-M5A7VMS3 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
H2-M5A7VMS3 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
H2-M5A7VMS3 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
H2-M5A7VMS3 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
H2-M5A7VMS3 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
H2-M5A7VMS3 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
H2-M5A7VMS3 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
H2-M5A7VMS3 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
H2-M5A7VMS3 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
H2-M5A7VMS3 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
H2-M5A7VMS3 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
H2-M5A7VMS3 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
H2-M5A7VMS3 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
H2-M5A7VMS3 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
H2-M5A7VMS3 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
H2-M5A7VMS3 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
H2-M5A7VMS3 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
H2-M5A7VMS3 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
H2-M5A7VMS3 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
H2-M5A7VMS3 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
H2-M5A7VMS3 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
H2-M5A7VMS3 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
H2-M5A7VMS3 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
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