Protein–RNA interactions for Protein: A3KGV1

Odf2, Outer dense fiber protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 830 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf2A3KGV1 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Odf2A3KGV1 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Odf2A3KGV1 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Odf2A3KGV1 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Odf2A3KGV1 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Odf2A3KGV1 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Odf2A3KGV1 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Odf2A3KGV1 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Odf2A3KGV1 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Odf2A3KGV1 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Odf2A3KGV1 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Odf2A3KGV1 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Odf2A3KGV1 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Odf2A3KGV1 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Odf2A3KGV1 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Odf2A3KGV1 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Odf2A3KGV1 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Odf2A3KGV1 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Odf2A3KGV1 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Odf2A3KGV1 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Odf2A3KGV1 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Odf2A3KGV1 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Odf2A3KGV1 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Odf2A3KGV1 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Odf2A3KGV1 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Odf2A3KGV1 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Odf2A3KGV1 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Odf2A3KGV1 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Odf2A3KGV1 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Odf2A3KGV1 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Odf2A3KGV1 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Odf2A3KGV1 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Odf2A3KGV1 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Odf2A3KGV1 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Odf2A3KGV1 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Odf2A3KGV1 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Odf2A3KGV1 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Odf2A3KGV1 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Odf2A3KGV1 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Odf2A3KGV1 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Odf2A3KGV1 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Odf2A3KGV1 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Odf2A3KGV1 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Odf2A3KGV1 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Odf2A3KGV1 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Odf2A3KGV1 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Odf2A3KGV1 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Odf2A3KGV1 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Odf2A3KGV1 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Odf2A3KGV1 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Odf2A3KGV1 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Odf2A3KGV1 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Odf2A3KGV1 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Odf2A3KGV1 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Odf2A3KGV1 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Odf2A3KGV1 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Odf2A3KGV1 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Odf2A3KGV1 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Odf2A3KGV1 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Odf2A3KGV1 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Odf2A3KGV1 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Odf2A3KGV1 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Odf2A3KGV1 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Odf2A3KGV1 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Odf2A3KGV1 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Odf2A3KGV1 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Odf2A3KGV1 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Odf2A3KGV1 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Odf2A3KGV1 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Odf2A3KGV1 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Odf2A3KGV1 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Odf2A3KGV1 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Odf2A3KGV1 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Odf2A3KGV1 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Odf2A3KGV1 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Odf2A3KGV1 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Odf2A3KGV1 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Odf2A3KGV1 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Odf2A3KGV1 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Odf2A3KGV1 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Odf2A3KGV1 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Odf2A3KGV1 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Odf2A3KGV1 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Odf2A3KGV1 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Odf2A3KGV1 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Odf2A3KGV1 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Odf2A3KGV1 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Odf2A3KGV1 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Odf2A3KGV1 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Odf2A3KGV1 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Odf2A3KGV1 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Odf2A3KGV1 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Odf2A3KGV1 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Odf2A3KGV1 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Odf2A3KGV1 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Odf2A3KGV1 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Odf2A3KGV1 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Odf2A3KGV1 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Odf2A3KGV1 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Odf2A3KGV1 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms