Protein–RNA interactions for Protein: A3KGF7

Plcb2, 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plcb2A3KGF7 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Plcb2A3KGF7 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Plcb2A3KGF7 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Plcb2A3KGF7 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Plcb2A3KGF7 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Plcb2A3KGF7 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Plcb2A3KGF7 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Plcb2A3KGF7 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Plcb2A3KGF7 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Plcb2A3KGF7 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Plcb2A3KGF7 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Plcb2A3KGF7 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Plcb2A3KGF7 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Plcb2A3KGF7 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Plcb2A3KGF7 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Plcb2A3KGF7 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Plcb2A3KGF7 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Plcb2A3KGF7 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Plcb2A3KGF7 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Plcb2A3KGF7 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Plcb2A3KGF7 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Plcb2A3KGF7 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Plcb2A3KGF7 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Plcb2A3KGF7 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Plcb2A3KGF7 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Plcb2A3KGF7 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Plcb2A3KGF7 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Plcb2A3KGF7 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Plcb2A3KGF7 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Plcb2A3KGF7 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Plcb2A3KGF7 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Plcb2A3KGF7 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Plcb2A3KGF7 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Plcb2A3KGF7 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Plcb2A3KGF7 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Plcb2A3KGF7 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Plcb2A3KGF7 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Plcb2A3KGF7 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Plcb2A3KGF7 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Plcb2A3KGF7 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Plcb2A3KGF7 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Plcb2A3KGF7 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Plcb2A3KGF7 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Plcb2A3KGF7 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Plcb2A3KGF7 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Plcb2A3KGF7 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Plcb2A3KGF7 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Plcb2A3KGF7 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Plcb2A3KGF7 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Plcb2A3KGF7 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Plcb2A3KGF7 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Plcb2A3KGF7 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Plcb2A3KGF7 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Plcb2A3KGF7 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Plcb2A3KGF7 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Plcb2A3KGF7 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Plcb2A3KGF7 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Plcb2A3KGF7 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Plcb2A3KGF7 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Plcb2A3KGF7 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Plcb2A3KGF7 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Plcb2A3KGF7 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Plcb2A3KGF7 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Plcb2A3KGF7 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Plcb2A3KGF7 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Plcb2A3KGF7 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Plcb2A3KGF7 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Plcb2A3KGF7 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Plcb2A3KGF7 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Plcb2A3KGF7 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Plcb2A3KGF7 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Plcb2A3KGF7 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Plcb2A3KGF7 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Plcb2A3KGF7 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Plcb2A3KGF7 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Plcb2A3KGF7 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Plcb2A3KGF7 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Plcb2A3KGF7 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Plcb2A3KGF7 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Plcb2A3KGF7 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Plcb2A3KGF7 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Plcb2A3KGF7 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Plcb2A3KGF7 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Plcb2A3KGF7 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Plcb2A3KGF7 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Plcb2A3KGF7 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Plcb2A3KGF7 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Plcb2A3KGF7 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Plcb2A3KGF7 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Plcb2A3KGF7 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Plcb2A3KGF7 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Plcb2A3KGF7 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Plcb2A3KGF7 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Plcb2A3KGF7 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Plcb2A3KGF7 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Plcb2A3KGF7 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Plcb2A3KGF7 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Plcb2A3KGF7 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Plcb2A3KGF7 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Plcb2A3KGF7 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms