Protein–RNA interactions for Protein: A3FIN4

Atp8b5, Phospholipid-transporting ATPase FetA, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b5A3FIN4 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp8b5A3FIN4 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp8b5A3FIN4 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp8b5A3FIN4 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp8b5A3FIN4 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp8b5A3FIN4 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp8b5A3FIN4 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp8b5A3FIN4 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp8b5A3FIN4 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp8b5A3FIN4 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp8b5A3FIN4 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp8b5A3FIN4 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp8b5A3FIN4 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp8b5A3FIN4 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp8b5A3FIN4 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp8b5A3FIN4 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp8b5A3FIN4 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp8b5A3FIN4 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp8b5A3FIN4 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp8b5A3FIN4 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp8b5A3FIN4 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp8b5A3FIN4 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp8b5A3FIN4 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp8b5A3FIN4 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp8b5A3FIN4 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp8b5A3FIN4 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp8b5A3FIN4 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp8b5A3FIN4 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp8b5A3FIN4 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp8b5A3FIN4 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp8b5A3FIN4 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp8b5A3FIN4 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp8b5A3FIN4 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp8b5A3FIN4 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp8b5A3FIN4 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp8b5A3FIN4 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp8b5A3FIN4 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp8b5A3FIN4 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp8b5A3FIN4 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp8b5A3FIN4 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp8b5A3FIN4 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp8b5A3FIN4 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp8b5A3FIN4 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp8b5A3FIN4 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp8b5A3FIN4 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp8b5A3FIN4 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp8b5A3FIN4 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp8b5A3FIN4 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp8b5A3FIN4 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp8b5A3FIN4 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp8b5A3FIN4 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp8b5A3FIN4 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp8b5A3FIN4 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp8b5A3FIN4 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp8b5A3FIN4 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp8b5A3FIN4 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp8b5A3FIN4 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp8b5A3FIN4 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp8b5A3FIN4 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp8b5A3FIN4 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp8b5A3FIN4 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp8b5A3FIN4 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp8b5A3FIN4 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp8b5A3FIN4 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp8b5A3FIN4 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp8b5A3FIN4 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp8b5A3FIN4 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp8b5A3FIN4 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp8b5A3FIN4 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp8b5A3FIN4 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp8b5A3FIN4 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp8b5A3FIN4 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp8b5A3FIN4 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp8b5A3FIN4 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp8b5A3FIN4 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp8b5A3FIN4 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp8b5A3FIN4 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp8b5A3FIN4 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp8b5A3FIN4 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp8b5A3FIN4 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp8b5A3FIN4 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp8b5A3FIN4 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp8b5A3FIN4 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp8b5A3FIN4 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp8b5A3FIN4 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp8b5A3FIN4 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp8b5A3FIN4 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp8b5A3FIN4 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp8b5A3FIN4 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp8b5A3FIN4 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp8b5A3FIN4 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp8b5A3FIN4 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp8b5A3FIN4 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp8b5A3FIN4 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp8b5A3FIN4 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp8b5A3FIN4 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp8b5A3FIN4 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp8b5A3FIN4 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp8b5A3FIN4 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp8b5A3FIN4 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
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