Protein–RNA interactions for Protein: A2APF3

Ctcfl, Transcriptional repressor CTCFL, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtcflA2APF3 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CtcflA2APF3 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CtcflA2APF3 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CtcflA2APF3 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CtcflA2APF3 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CtcflA2APF3 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CtcflA2APF3 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CtcflA2APF3 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
CtcflA2APF3 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CtcflA2APF3 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CtcflA2APF3 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CtcflA2APF3 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CtcflA2APF3 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CtcflA2APF3 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CtcflA2APF3 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CtcflA2APF3 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CtcflA2APF3 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CtcflA2APF3 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CtcflA2APF3 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CtcflA2APF3 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CtcflA2APF3 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CtcflA2APF3 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CtcflA2APF3 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CtcflA2APF3 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CtcflA2APF3 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CtcflA2APF3 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CtcflA2APF3 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CtcflA2APF3 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CtcflA2APF3 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CtcflA2APF3 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CtcflA2APF3 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CtcflA2APF3 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CtcflA2APF3 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CtcflA2APF3 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CtcflA2APF3 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CtcflA2APF3 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CtcflA2APF3 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CtcflA2APF3 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CtcflA2APF3 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
CtcflA2APF3 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
CtcflA2APF3 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CtcflA2APF3 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
CtcflA2APF3 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CtcflA2APF3 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CtcflA2APF3 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
CtcflA2APF3 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
CtcflA2APF3 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CtcflA2APF3 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CtcflA2APF3 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CtcflA2APF3 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CtcflA2APF3 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CtcflA2APF3 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CtcflA2APF3 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CtcflA2APF3 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
CtcflA2APF3 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CtcflA2APF3 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CtcflA2APF3 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CtcflA2APF3 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CtcflA2APF3 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CtcflA2APF3 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CtcflA2APF3 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CtcflA2APF3 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CtcflA2APF3 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CtcflA2APF3 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CtcflA2APF3 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
CtcflA2APF3 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CtcflA2APF3 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CtcflA2APF3 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CtcflA2APF3 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CtcflA2APF3 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CtcflA2APF3 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CtcflA2APF3 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CtcflA2APF3 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CtcflA2APF3 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CtcflA2APF3 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CtcflA2APF3 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CtcflA2APF3 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CtcflA2APF3 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CtcflA2APF3 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CtcflA2APF3 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
CtcflA2APF3 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
CtcflA2APF3 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
CtcflA2APF3 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CtcflA2APF3 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CtcflA2APF3 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CtcflA2APF3 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CtcflA2APF3 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CtcflA2APF3 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CtcflA2APF3 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CtcflA2APF3 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CtcflA2APF3 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CtcflA2APF3 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CtcflA2APF3 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CtcflA2APF3 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CtcflA2APF3 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
CtcflA2APF3 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CtcflA2APF3 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CtcflA2APF3 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CtcflA2APF3 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CtcflA2APF3 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
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