Protein–RNA interactions for Protein: A2AM80

Fam43b, Family with sequence similarity 43, member B, mousemouse

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Length 330 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam43bA2AM80 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fam43bA2AM80 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fam43bA2AM80 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fam43bA2AM80 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Fam43bA2AM80 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fam43bA2AM80 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fam43bA2AM80 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fam43bA2AM80 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fam43bA2AM80 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fam43bA2AM80 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fam43bA2AM80 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fam43bA2AM80 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fam43bA2AM80 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fam43bA2AM80 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fam43bA2AM80 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fam43bA2AM80 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam43bA2AM80 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam43bA2AM80 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam43bA2AM80 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam43bA2AM80 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam43bA2AM80 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam43bA2AM80 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam43bA2AM80 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam43bA2AM80 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam43bA2AM80 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam43bA2AM80 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam43bA2AM80 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam43bA2AM80 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam43bA2AM80 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam43bA2AM80 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam43bA2AM80 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam43bA2AM80 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam43bA2AM80 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam43bA2AM80 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam43bA2AM80 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam43bA2AM80 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam43bA2AM80 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam43bA2AM80 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam43bA2AM80 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam43bA2AM80 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam43bA2AM80 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam43bA2AM80 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam43bA2AM80 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam43bA2AM80 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fam43bA2AM80 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fam43bA2AM80 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fam43bA2AM80 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fam43bA2AM80 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fam43bA2AM80 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fam43bA2AM80 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fam43bA2AM80 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fam43bA2AM80 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fam43bA2AM80 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Fam43bA2AM80 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fam43bA2AM80 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Fam43bA2AM80 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fam43bA2AM80 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Fam43bA2AM80 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Fam43bA2AM80 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Fam43bA2AM80 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fam43bA2AM80 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fam43bA2AM80 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fam43bA2AM80 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fam43bA2AM80 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fam43bA2AM80 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fam43bA2AM80 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fam43bA2AM80 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fam43bA2AM80 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fam43bA2AM80 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fam43bA2AM80 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam43bA2AM80 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam43bA2AM80 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam43bA2AM80 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam43bA2AM80 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam43bA2AM80 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam43bA2AM80 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam43bA2AM80 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam43bA2AM80 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam43bA2AM80 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam43bA2AM80 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam43bA2AM80 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam43bA2AM80 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam43bA2AM80 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam43bA2AM80 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam43bA2AM80 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam43bA2AM80 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam43bA2AM80 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam43bA2AM80 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam43bA2AM80 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam43bA2AM80 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam43bA2AM80 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam43bA2AM80 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam43bA2AM80 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam43bA2AM80 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam43bA2AM80 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam43bA2AM80 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam43bA2AM80 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam43bA2AM80 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam43bA2AM80 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam43bA2AM80 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms