Protein–RNA interactions for Protein: A2ALK8

Ptpn3, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 3, mousemouse

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn3A2ALK8 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptpn3A2ALK8 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptpn3A2ALK8 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptpn3A2ALK8 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptpn3A2ALK8 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptpn3A2ALK8 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptpn3A2ALK8 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptpn3A2ALK8 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptpn3A2ALK8 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptpn3A2ALK8 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptpn3A2ALK8 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptpn3A2ALK8 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptpn3A2ALK8 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptpn3A2ALK8 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptpn3A2ALK8 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptpn3A2ALK8 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptpn3A2ALK8 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptpn3A2ALK8 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptpn3A2ALK8 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptpn3A2ALK8 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptpn3A2ALK8 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptpn3A2ALK8 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptpn3A2ALK8 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ptpn3A2ALK8 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ptpn3A2ALK8 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ptpn3A2ALK8 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ptpn3A2ALK8 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ptpn3A2ALK8 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ptpn3A2ALK8 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ptpn3A2ALK8 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ptpn3A2ALK8 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ptpn3A2ALK8 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ptpn3A2ALK8 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ptpn3A2ALK8 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ptpn3A2ALK8 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ptpn3A2ALK8 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ptpn3A2ALK8 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ptpn3A2ALK8 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ptpn3A2ALK8 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ptpn3A2ALK8 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ptpn3A2ALK8 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ptpn3A2ALK8 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ptpn3A2ALK8 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ptpn3A2ALK8 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ptpn3A2ALK8 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ptpn3A2ALK8 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ptpn3A2ALK8 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ptpn3A2ALK8 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ptpn3A2ALK8 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ptpn3A2ALK8 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ptpn3A2ALK8 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ptpn3A2ALK8 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ptpn3A2ALK8 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ptpn3A2ALK8 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ptpn3A2ALK8 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ptpn3A2ALK8 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ptpn3A2ALK8 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ptpn3A2ALK8 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ptpn3A2ALK8 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ptpn3A2ALK8 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ptpn3A2ALK8 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ptpn3A2ALK8 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ptpn3A2ALK8 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ptpn3A2ALK8 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ptpn3A2ALK8 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ptpn3A2ALK8 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ptpn3A2ALK8 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ptpn3A2ALK8 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ptpn3A2ALK8 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ptpn3A2ALK8 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ptpn3A2ALK8 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ptpn3A2ALK8 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ptpn3A2ALK8 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ptpn3A2ALK8 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ptpn3A2ALK8 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ptpn3A2ALK8 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ptpn3A2ALK8 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ptpn3A2ALK8 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ptpn3A2ALK8 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ptpn3A2ALK8 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ptpn3A2ALK8 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ptpn3A2ALK8 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ptpn3A2ALK8 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ptpn3A2ALK8 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ptpn3A2ALK8 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ptpn3A2ALK8 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ptpn3A2ALK8 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ptpn3A2ALK8 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ptpn3A2ALK8 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ptpn3A2ALK8 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ptpn3A2ALK8 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ptpn3A2ALK8 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ptpn3A2ALK8 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ptpn3A2ALK8 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ptpn3A2ALK8 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ptpn3A2ALK8 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ptpn3A2ALK8 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ptpn3A2ALK8 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ptpn3A2ALK8 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ptpn3A2ALK8 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms