Protein–RNA interactions for Protein: A2AFR3

Frmpd4, FERM and PDZ domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd4A2AFR3 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Frmpd4A2AFR3 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Frmpd4A2AFR3 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Frmpd4A2AFR3 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Frmpd4A2AFR3 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Frmpd4A2AFR3 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC17.89■□□□□ 0.46
Frmpd4A2AFR3 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Frmpd4A2AFR3 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Frmpd4A2AFR3 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Frmpd4A2AFR3 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Frmpd4A2AFR3 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Frmpd4A2AFR3 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Frmpd4A2AFR3 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Frmpd4A2AFR3 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Frmpd4A2AFR3 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Frmpd4A2AFR3 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Frmpd4A2AFR3 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Frmpd4A2AFR3 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Frmpd4A2AFR3 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Frmpd4A2AFR3 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Frmpd4A2AFR3 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Frmpd4A2AFR3 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Frmpd4A2AFR3 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Frmpd4A2AFR3 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Frmpd4A2AFR3 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Frmpd4A2AFR3 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Frmpd4A2AFR3 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Frmpd4A2AFR3 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Frmpd4A2AFR3 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Frmpd4A2AFR3 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Frmpd4A2AFR3 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Frmpd4A2AFR3 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Frmpd4A2AFR3 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Frmpd4A2AFR3 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Frmpd4A2AFR3 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Frmpd4A2AFR3 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Frmpd4A2AFR3 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Frmpd4A2AFR3 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Frmpd4A2AFR3 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Frmpd4A2AFR3 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Frmpd4A2AFR3 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Frmpd4A2AFR3 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Frmpd4A2AFR3 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Frmpd4A2AFR3 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Frmpd4A2AFR3 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Frmpd4A2AFR3 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Frmpd4A2AFR3 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Frmpd4A2AFR3 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Frmpd4A2AFR3 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Frmpd4A2AFR3 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Frmpd4A2AFR3 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Frmpd4A2AFR3 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Frmpd4A2AFR3 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Frmpd4A2AFR3 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Frmpd4A2AFR3 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Frmpd4A2AFR3 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Frmpd4A2AFR3 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Frmpd4A2AFR3 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Frmpd4A2AFR3 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Frmpd4A2AFR3 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Frmpd4A2AFR3 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Frmpd4A2AFR3 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Frmpd4A2AFR3 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Frmpd4A2AFR3 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Frmpd4A2AFR3 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Frmpd4A2AFR3 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Frmpd4A2AFR3 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Frmpd4A2AFR3 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Frmpd4A2AFR3 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Frmpd4A2AFR3 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Frmpd4A2AFR3 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Frmpd4A2AFR3 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Frmpd4A2AFR3 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Frmpd4A2AFR3 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Frmpd4A2AFR3 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Frmpd4A2AFR3 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Frmpd4A2AFR3 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Frmpd4A2AFR3 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Frmpd4A2AFR3 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Frmpd4A2AFR3 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Frmpd4A2AFR3 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Frmpd4A2AFR3 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Frmpd4A2AFR3 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Frmpd4A2AFR3 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Frmpd4A2AFR3 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Frmpd4A2AFR3 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Frmpd4A2AFR3 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Frmpd4A2AFR3 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Frmpd4A2AFR3 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Frmpd4A2AFR3 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Frmpd4A2AFR3 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Frmpd4A2AFR3 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Frmpd4A2AFR3 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Frmpd4A2AFR3 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Frmpd4A2AFR3 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Frmpd4A2AFR3 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Frmpd4A2AFR3 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Frmpd4A2AFR3 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Frmpd4A2AFR3 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Frmpd4A2AFR3 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.7 ms